Das Leibniz-Institut zur Analyse des Biodiversitätswandels

ist ein Forschungsmuseum der Leibniz Gemeinschaft

Metabarcoding

Reiter

Info

DNA Metabarcoding ermöglicht die Identifikation von tausenden Individuen, oft bis auf Artebene, durch die Sequenzierung eines kleinen, standardisierten Genfragmentes. Anders als bei der DNA-Barcodierung, wird dies mit der gesamten Artengemeinschaft eines Habitats durchgeführt, um eine schnellere Bewertung der Artenvielfalt zu ermöglichen.

Unsere Forschungsprojekte konzentrieren sich auf:

Biomonitoring terrestrischer und aquatischer Ökosysteme
Struktur der Artengemeinschaft und Veränderung des Ökosystems
Entwicklung von DNA Metabarcoding Methoden
Bioinformatik
Large scale Laborabläufe
Ernährungs- und Darminhaltsanalysen
Wirt-Parasit-Interaktionen
Mitogenomik und ‘PCR-freie’ Methoden

Wir sind immer auf der Suche nach talentierten und ehrgeizigen Studenten, die mit uns an bestehenden Forschungsprojekten arbeiten möchten.

Mitarbeiterinnen & Mitarbeiter

Wissenschaftlerin / Wissenschaftler, Festanstellung

Dr. Sarah Bourlat

Sektionsleiterin Metabarcoding, Ombudsperson - Sicherung der Guten wissenschaftlichen Praxis (Vertretung)

Tel: +49 228 9122-353

Fax: +49 228 9122-212

E-Mail: s.bourlat [at] leibniz-lib.de

Technisches Personal

Ashley Nicole Fulgham-Scott

Technische Assistenz Metabarcoding

E-Mail: nicolefulghamscott [at] gmail.com

Dr. Kathrin Langen

Technische Assistentin

Tel: +49 228 9122-354

Fax: +49 228 9122-295

E-Mail: k.langen [at] leibniz-lib.de

Wissenschaftlerin / Wissenschaftler, Drittmittel

Dr. Carolina Corrales Duque

BGE Projekt

Tel: +49 228 9122-420

Fax: +49 228 9122-212

E-Mail: c.corrales [at] leibniz-lib.de

Postdoktorandin / Postdoktorand

Dr. Ameli Kirse

Postdoc

Tel: +49 228 9122-453

Fax: +49 228 9122-212

E-Mail: A.Kirse [at] leibniz-lib.de

Leighton Thomas, PhD

AMMOD Projekt

E-Mail: l.thomas [at] leibniz-lib.de

Alumni & Alumnae

Ehemalige Mitarbeiterinnen / Mitarbeiter

Dr. Vera G. Fonseca

ehemalige Sektionsleiterin Metabarcoding

E-Mail: v.fonseca [at] leibniz-zfmk.de

Ehemalige Studenteninnen / Studenten

Felix Pleiss

MSc Student

Fax: +49 228 9122-212

E-Mail: felixpleiss [at] rub.de

Projekte

2022

BioMonitor4CAP

Im Rahmen des EU-Projekts "BioMonitor4CAP" wird ein modernes Biodiversitätsmonitoring für eine ergebnisorientierte und effektive Agrarpolitik und Transformation entwickelt.

Projektleitung:

Prof. Dr. Christoph Scherber

Finanzierung:

Europäische Union

BGE - Biodiversity Genomics Europe

Das Projekt Biodiversity Genomics Europe (BGE)(link is external) hat das übergeordnete Ziel, die Nutzung der Genomik zu beschleunigen, um das Verständnis der biologischen Vielfalt zu verbessern, Veränderungen in der biologischen Vielfalt zu überwachen und Maßnahmen zur Bekämpfung ihres Rückgangs zu ergreifen.Trotz der bahnbrechenden Entwicklungen sowohl bei der DNA-Barcodierung als auch bei der vollständigen Genomsequenzierung besteht nach wie vor die dringende Notwendigkeit, funktionierende Praxisgemeinschaften auf verschiedenen Ebenen zu entwickeln und zu stärken, um Kapazitäten aufzubauen,

Projektleitung:

Astrid Böhne

Finanzierung:

Europäische Union

2021

Hybridschwarmevolution in Elritzen

In der Biodiversitätsforschung ist bislang nur wenig darüber bekannt, inwiefern Hybridisierung einer einheimischen und nicht einheimischen Art zu einer neuen ihrerseits invasiven Art führen kann. Eine Forschungsgruppe um Dr. Madlen Stange widmet sich nun dieser Forschungslücke mit einem Vorhaben am Zoologischen Forschungsmuseum Alexander Koenig – Leibniz-Institut für Biodiversität der Tiere. Die Gruppe untersucht die Verbreitung des ökologisch wertvollen Schwarmfisches Elritze u.a. in der Sieg, einem etwa 155 Kilometer langem Nebenfluss des Rheins.

Projektleitung:

Dr. Madlen Stange

Finanzierung:

Leibniz-Gemeinschaft

BALIN: Insektenschutz an Bahnhöfen

Das BALIN Projekt ist inhaltlich im Handlungsfeld Lichtverschmutzung des Aktionsprogramms Insektenschutz der Bundesregierung angesiedelt. Personenbahnhöfe und Haltestellen der Bahn sind in Deutschland regelmäßig beleuchtet, um die Sicherheit, die Orientierung auf dem Bahngelände, die Einhaltung der Barrierefreiheit sowie die Prävention von Vandalismus zu gewährleisten. Die Beleuchtung unterliegt dabei strengen Anforderungen, die an allen Bahnhöfen in Deutschland eingehalten werden müssen.

Projektleitung:

Prof. Dr. Christoph Scherber

2020

GBOL III: Dark Taxa

The BMBF-funded GBOL, the German Barcode of Life initiative, has been run successfully over the last eight years. It delivered an operative DNA barcode reference library for German animals, fungi and plants. However, a significant proportion of insect taxa has so far been excluded from GBOL and merely all biodiversity research, because no or only very insufficient expertise and information are available that allow to get a grip on them. They are called “Dark Taxa”.

Projektleitung:

Dr. Ralph S. Peters

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

2019

AMMOD: Eine „Wetterstation für Artenvielfalt“

Eine „Wetterstation für Artenvielfalt“ (AMMOD = Automated Multisensor Station for Monitoring of Species Diversity).

Projektleitung:

Prof. Dr. J. Wolfgang Wägele

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

DINA – Diversity of Insects in Nature Protected Areas

Vor dem Hintergrund des in Deutschland dokumentierten dramatischen Insektenrückgangs in Naturschutzgebieten wurde das Projekt DINA (Diversität von Insekten in Naturschutz-Arealen) entwickelt. In einem multidisziplinären Ansatz werden naturwissenschaftliche Ergebnisse mit sozio-ökonomischen Aspekten und der Perspektive von relevanten Teilhabern integriert.

Projektleitung:

Dr. Livia Schäffler

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

Biodiversitätsverlust stoppen durch verbessertes Aufspüren von bedrohten wirbellosen Tieren

In today’s biodiversity crisis, there is an urgent need to monitor terrestrial and aquatic species in their natural habitats, especially those that may be endangered, invasive or elusive. Traditional species observation methods, based on acoustic or observational surveys are inefficient, costly and time consuming. On the other hand, DNA is continuously deposited in the environment from natural processes and this environmental DNA (eDNA) allows us to detect species and reconstruct their communities with a high level of sensitivity.

Projektleitung:

Dr. Sarah Bourlat

2017

GGBC: Erfassung, Monitoring und Management der Kaukasischen Biodiversität

Eine georgisch-deutsche Initiative, um die kaukasische Biodiversität zu erforschen und zu barcoden

Projektleitung:

Prof. Dr. Bernhard Misof

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

2011

GBOL- German Barcode of Life

German Barcode of Life ( GBOL ) ist ein vom BMBF gefördertes Projekt zur Inventarisierung und genetischen Charakterisierung der Tiere, Pflanzen und Pilze Deutschlands anhand von DNA-Barcodes.

Projektleitung:

Prof. Dr. J. Wolfgang Wägele

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

Publikationen

Publiziert in

2024

Zizka, V.M.A., Langen, K., Kirse, A., Scherges, A.M., Bourlat, S.J. (2024) Non-destructive DNA extraction and metabarcoding of arthropod bulk samples: a step-by-step protocol. In: Wägele, J.W., Tschan, G.F. (Eds) Weather stations for biodiversity: a comprehensive approach to an automated and modular monitoring system. Advanced Books, Pensoft, 87-102. https://doi.org/10.3897/ab.e119534

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