Das Leibniz-Institut zur Analyse des Biodiversitätswandels

ist ein Forschungsmuseum der Leibniz Gemeinschaft

Dr. Ameli Kirse

Postdoc

Metabarcoding

Tel: +49 (0)228 9122 453

Fax: +49 (0)228 9122 212

E-Mail: A.Kirse [at] leibniz-lib.de

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Projekte

2022

BioMonitor4CAP

Im Rahmen des EU-Projekts "BioMonitor4CAP" wird ein modernes Biodiversitätsmonitoring für eine ergebnisorientierte und effektive Agrarpolitik und Transformation entwickelt.

Abteilung/Sektion:

Zentrum für Biodiversitätsmonitoring und Naturschutzforschung (zbm), Metabarcoding, Besuchenden- & Bildungsforschung, Experimentelle und Angewandte Ökologie, Verwaltung

Projektleitung:

Prof. Dr. Christoph Scherber

Finanzierung:

Europäische Union

2019

AMMOD: Eine „Wetterstation für Artenvielfalt“

Eine „Wetterstation für Artenvielfalt“ (AMMOD = Automated Multisensor Station for Monitoring of Species Diversity).

Abteilung/Sektion:

Zentrum für Biodiversitätsmonitoring und Naturschutzforschung (zbm), Biodiversitätsinformatik, Metabarcoding

Projektleitung:

Prof. Dr. J. Wolfgang Wägele

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

2017

GGBC: Erfassung, Monitoring und Management der Kaukasischen Biodiversität

Eine georgisch-deutsche Initiative, um die kaukasische Biodiversität zu erforschen und zu barcoden

Abteilung/Sektion:

Direktion, Lehrstuhl Spezielle Zoologie, Biobank, Abteilung Arthropoda, Coleoptera, Theriologie, Lepidoptera, Herpetologie, Verwaltung, ZFMK Internationale Graduiertenschule, Biodiversitätsinformatik, Metabarcoding, Myriapoda, Arachnida, Personalrat, Diptera, Hymenoptera, Vergleichende Genomik (Insekten)

Projektleitung:

Prof. Dr. Bernhard Misof

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

2011

GBOL- German Barcode of Life

German Barcode of Life ( GBOL ) ist ein vom BMBF gefördertes Projekt zur Inventarisierung und genetischen Charakterisierung der Tiere, Pflanzen und Pilze Deutschlands anhand von DNA-Barcodes.

Projektleitung:

Prof. Dr. J. Wolfgang Wägele

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

Publikationen

Kirse, A., Bourlat, S.J., Langen, K. et al. Metabarcoding Malaise traps and soil eDNA reveals seasonal and local arthropod diversity shifts. Sci Rep 11, 10498 (2021). https://doi.org/10.1038/s41598-021-89950-6

Kirse, A., Bourlat, S. J., Langen, K., & Fonseca, V. G. (2021). Unearthing the potential of soil eDNA metabarcoding–towards best practice advice for invertebrate biodiversity assessment. Frontiers in Ecology and Evolution, 9, 337.

Publiziert in

2023

Bourlat S.J., Koch M., Kirse A., Langen K., Espeland M., Giebner H., Decher J., Ssymank A., Fonseca V.G. (2023) Metabarcoding dietary analysis in the insectivorous bat Nyctalus leisleri and implications for conservation. Biodiversity Data Journal 11: e111146. https://doi.org/10.3897/BDJ.11.e111146

[Mehr]

2022

Wägele J. W., Bodesheim P., Bourlat S. J., Denzler J., Diepenbroek M., Fonseca V., Frommolt K.-H., Geiger M. F., Gemeinholzer B., Glöckner F. O., Haucke T., Kirse A., Kölpin A., Kostadinov I., Kühl H. S., Kurth F., Lasseck M., Liedke S., Losch F., Müller S., Petrovskaya N., Piotrowski K., Radig B., Scherber C., Schoppmann L., Schulz J., Steinhage V., Tschan G. F., Vautz W., Velotto D., Weigend M., Wildermann S. (2022) Towards a multisensor station for automated biodiversity monitoring. Basic and Applied Ecology 59:105-138.

[Mehr]

Links:

https://doi.org/10.1016/j.baae.2022.01.003

Fonseca, V.G., Kirse, A., Giebner, H. et al. Metabarcoding the Antarctic Peninsula biodiversity using a multi-gene approach. ISME COMMUN. 2, 37 (2022). https://doi.org/10.1038/s43705-022-00118-3

[Mehr]

Kirse, A., Bourlat, S. J., Langen, K., Zapke, B., & Zizka, V. M. A. (2022). Comparison of destructive and nondestructive DNA extraction methods for the metabarcoding of arthropod bulk samples. Molecular Ecology Resources, 00, 1– 14.

[Mehr]

Zizka, V. M., Geiger, M. F., Hörren, T., Kirse, A., Noll, N. W., Schäffler, L., Scherges, A. M., Sorg, M. (2022): Repeated subsamples during DNA extraction reveal increased diversity estimates in DNA metabarcoding of Malaise traps. - Ecology and Evolution, 12(11), e9502.

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2021

[Mehr]

ab 2020 wissenschaftliche Mitarbeiterin im AMMOD Projekt, Forschungsmuseum Alexander Koenig, Bonn

2016 - 2020 Promotion "Metabarcoding Invertebrate Communities in a Natural Park: From Methods to Diversity Patterns", Universität Bonn

2013 - 2016 Master of Science in Organismic Biology, Evolutionary Biology and Palaeobiology, rheinische Friedrich-Wilhelms Universität Bonn; Abschlussarbeit "Metabarcoding – From Methods to Ecological Patterns"

2010 - 2013 Bachelor of Science in Biowissenschaften, Julius-Maximilians-Universität Würzburg; Abschlussarbeit "Reproductive Success of Rape Pollen Beetles (Meligethes aeneus) Depending on Landscape Parameters".

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