Das Leibniz-Institut zur Analyse des Biodiversitätswandels

ist ein Forschungsmuseum der Leibniz Gemeinschaft

Vergleichende Genomik (Insekten)

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Info

Neue experimentelle und Datenverarbeitungstechniken offerieren uns ganz neue Möglichkeiten Organismen auf genomischer Ebene zu vergleichen und so zu verstehen, wie Genome evolvieren und wie neue phenotypische Charakteristika entstehen. Somit lässt sich die Entstehung und Veränderung von Biodiversität selbst nachvollziehen. Insekten, als artenreichste Gruppe höherer Eukaryoten, sind ein besonders vielversprechendes System um die Komplexitäten evolutionärer Innovation aufzudecken.

Mitarbeiterinnen & Mitarbeiter

Wissenschaftlerin / Wissenschaftler, Festanstellung

Dr. Eckart Stolle

Sektionsleiter

Tel: +49 228 9122-421

Fax: +49 228 9122-212

E-Mail: e.stolle [at] leibniz-zfmk.de

Wissenschaftlerin / Wissenschaftler, Gast

Francieli das Chagas

PostDoc

E-Mail: franci_chagas [at] hotmail.com

Patrick Souza

Gast-Wissenschaftler

E-Mail: patricksouzz [at] gmail.com

Doktorandin / Doktorand

Nathalie Brenner

Doktorandin

Fax: +49 228 9122-212

E-Mail: n.brenner [at] leibniz-zfmk.de

Xuejing Hu

PhD Studentin

E-Mail: xuejing.hu [at] outlook.com

Elisabeth Karalashvili

Doktorandin

Tel: +49 228 9122-379

Fax: +49 228 9122-212

E-Mail: e.karalashvili [at] leibniz-lib.de

Johanna Pieplow

Doktorandin

Fax: +49 228 9122-212

E-Mail: johanna.pieplow [at] web.de

Manwen Su

PhD Studentin

E-Mail: M.Su [at] leibniz-lib.de

Masterkandidatin / Masterkandidat

Eva Baumgarten

MSc Studentin

Tel: +49 228 9122-407

Fax: +49 228 9122-212

E-Mail: E.Baumgarten [at] leibniz-lib.de

Projekte

2023

BIGFOOT

Wir stehen vor einer globalen Biodiversitätskrise von beispiellosem Ausmaß mit verheerenden Folgen für die Lebensfähigkeit des Ökosystems. Neben der anthropogenen Lebensraumzerstörung, der Fragmentierung und dem Klimawandel kann die Genomik das Schicksal einer Population bestimmen, aber auch zur Beurteilung ihrer Gesundheit herangezogen werden. Genomische Muster des Artenrückgangs wurden jedoch nur für einige wenige symbolträchtige Säugetierarten nachgewiesen. Die Populationen einiger im Rückgang begriffener Arten werden meist durch klassische Zensus-Überwachung (z. B.

Projektleitung:

Astrid Böhne

Finanzierung:

Leibniz-Gemeinschaft

2022

evolution of cleptoparasitism

Recurring phenotypic loss: Repeatability of genome and regulatory evolutionDFG Priority Program

Projektleitung:

Dr. Eckart Stolle

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

DeRGA - Deutscher ReferenzG...

Deutscher Hub des Europäischen Referenz-Genom-AtlasAufbauend auf der Mission von ERGA (European Reference Genome Atlas) hat die deutsche Biodiversitätsgenomik-Gemeinschaft das Ziel, qualitativ hochwertige Referenzgenome der deutschen eukaryotischen Biodiversität zu generieren:Unsere Initiative vernetzt die Biodiversitätsgenomik-Expertise in ganz Deutschland, einschließlich der wissenschaftlichen Exzellenz von Universitäten, Forschungsmuseen und akademischen Einrichtungen, NGS-Sequenzierungskompetenz, HPC-Infrastruktur und translationalem Wissenstransfer.

Projektleitung:

Astrid Böhne

ERGA - The European Referen...

Die Initiative Europäischer ReferenzGenom Atlas (ERGA) ist eine gesamteuropäische wissenschaftliche Antwort auf die aktuelle Bedrohung der biologischen Vielfalt. Referenzgenome bieten den umfassendsten Einblick in die genetische Grundlage jeder Art und stellen eine wichtige Ressource für das Verständnis der Funktionsweise der biologischen Vielfalt dar. ERGA zielt darauf ab, die Genome aller europäischen Arten zu sequenzieren und wird zu diesem Zweck einen interdisziplinären Arbeitsablauf einrichten.

Projektleitung:

Astrid Böhne

Finanzierung:

Europäische Union

stingless bee genomics

Comparative genomics and phenotypic loss in stingless bees.

Projektleitung:

Dr. Eckart Stolle

Finanzierung:

Deutscher Akademischer Austauschdienst

2021

CORBICULA

Humandkind's most important insect leg - the bee corbicula

Projektleitung:

Dr. Eckart Stolle

Finanzierung:

Europäische Union

Thelytokie in Honigbienen

Genomische Langzeitkonsequenzen thelytoker VermehrungVerluste von HeterozygotieAssociative ÜberdominanzGenomische Regulation von Thelytokie in Honigbienen

Projektleitung:

Dr. Eckart Stolle

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

Bumblebee Phenotypic Evolution

Bumblebee Phenotypic Evolution - We will study phenotypic evolution in bumblebees, repeatability of evolution and evolutionary constraints using genomics and transcriptomics.

Projektleitung:

Dr. Eckart Stolle

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

2019

Bombus terrestris genome

Using long read sequencing of DNA and RNA we will improve the genome sequence assembly and annotation of the bufftailed bumblebee Bombus terrestris.

Projektleitung:

Dr. Eckart Stolle

Finanzierung:

Europäische Union

2017

GGBC: Erfassung, Monitoring und Management der Kaukasischen Biodiversität

Eine georgisch-deutsche Initiative, um die kaukasische Biodiversität zu erforschen und zu barcoden

Projektleitung:

Prof. Dr. Bernhard Misof

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

Publikationen

Publiziert in

2024

Seropian, A., Bulbulashvili, N., Krammer, H. J., Thormann, J., Hein, N., Karalashvili, E., Kachlishvili, N. & Datunashvili, A. (2024). Picking pearls from the Silk Road: Insights into the spider (Arachnida, Araneae) diversity in Georgia from the Caucasus Barcode of Life (CaBOL) project. Part III. Caucasiana, 3, 89-118.

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Links:

https://doi.org/10.3897/caucasiana.3.e120883

2023

Dietz L., Mayer C., Stolle E., Eberle J., Misof B., Podsiadlowski L., Niehuis O., Ahrens, D., (2023) Metazoa-level USCOs as markers in species delimitation and classification Mol. Ecol Res. DOI: 10.1111/1755-0998.13921 DOI: 10.1111/1755-0998.13921

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Stolle E, Guiglielmoni N, Kirangwa J, Kukowka S, Meitzel T, Mc Cartney A, Heilmann-Heimbach S, Becker K, Köhrer K and Böhne A. (2023) Reference genome sequence of the solitary bee Camptopoeum friesei Mocsáry, 1894 (Hymenoptera, Andrenidae). bioRxiv 2023.08.27.555015, doi: 10.1101/2023.08.27.555015

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Links:

Reference genome sequence of the solitary bee Camptopoeum friesei Mocsáry, 1894 (Hymenoptera, Andrenidae)

Fleites-Ayil, F.A, Medina-Medina, L.A., Quezada Euán, J.J.G., Stolle, E., Theodorou, P., Tragust, S., Paxton, R.J. (2023): Trouble in the tropics: Pathogen spillover is a threat for native stingless bees. Biological Conservation 284: 110150.

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Koludarov, I., Velasque, M., Timm, T., Lochnit, G., Heinzinger, M., Vilcinskas, A., Gloag, R., Harpur, B.A., Podsiadlowski, L., Rost, B., Dutertre, S., Stolle, E., von Reumont, B.M. (2023). A common venomous ancestor? Prevalent bee venom genes evolved before the aculeate stinger while few major toxins are bee specific. BMC Biology, accepted

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Webster, M.T. , Beaurepaire, A., Neumann, P., Stolle, E. (2023): Population genomics for insect conservation. Annual Review of Animal Biosciences 11: 115-140.

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2022

Stolle, Eckart; Pracana, Rodrigo; López-Osorio, Federico; Priebe, Marian K.; Hernández, Gabriel Luis; Castillo-Carrillo, Claudia; Arias, Maria Cristina; Paris, Carolina Ivon; Bollazzi, Martin; Priyam, Anurag; Wurm, Yannick. Recurring adaptive introgression of a supergene variant that determines social organization. Nature Communications 13: 1180 (2022)

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2021

Dogantzis, KA; Tiwari, T; Conflitti, IM; Dey, A; Patch, HM,;Muli, EM; Garnery, L; Whitfield, CW; Stolle, E; Alqarni, AS; Allsopp, MH; Zayed, A. Thrice out of Asia and the adaptive radiation of the western honey bee. Science Advances 7 (49)

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Séguret, A. C., Stolle, E., Fleites-Ayil, F. A., Quezada-Euán, J. J. G., Hartfelder, K., Meusemann, K., Harrison, M., et al. (2021): Transcriptomic signatures of ageing vary in solitary and social forms of an orchid bee. - Genome Biology and Evolution 13 (6): evab075. https://doi.org/10.1093/gbe/evab075.

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Links:

https://doi.org/10.1093/gbe/evab075

2020

Kapheim, K., Jones, B. M., Pan, H., Li, C., Harpur, B. A., Kent, C., Zayed, A., Ioannidis, P., Waterhouse, R. M., Kingwell, C., Stolle, E., Avalos, A., Zhang, G., McMillan, W. O., Wcislo, W. T. (2020): Developmental plasticity shapes social traits and selection in a facultatively eusocial bee. PNAS 117 (24): 13615-13625

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Kapheim, K., Jones, B. M., Søvik, E., Stolle, E., Waterhouse, R. M., Bloch, G., Ben-Shahar, Y. (2020): Brain microRNAs among social and solitary bees. Royal Society Open Science 7 (7): 200517

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Martinez-Ruiz, C., Pracana, R., Stolle, E., Paris, C. I., Nichols, R., Wurm, Y. (2020): Genomic architecture and evolutionary antagonism drive allelic expression bias in the social supergene of red fire ants. eLife 2020 (9): e55862

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Saure, C., Dziock, F., Jentzsch, M., Stolle, E. (2020): Rote Listen Sachsen-Anhalt: Schwebfliegen (Diptera: Syrphidae). Berichte des Landesamtes für Umweltschutz Sachsen-Anhalt 1: 895–905.

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Saure, C., Stolle, E. (2020): Rote Listen Sachsen-Anhalt: Stechwespen (Hymenoptera: Aculeata). Berichte des Landesamtes für Umweltschutz Sachsen-Anhalt 1: 791-806.

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Séguret A. C., Stolle E., Fleites-Ayil, F. A., Quezada-Euán J. J. G., Hartfelder K., Meusemann K., Harrison M., Soro A., Paxton R. J. (2020): Transcriptomic signatures of ageing vary in solitary and social forms of an orchid bee. bioRxiv, doi: https://doi.org/10.1101/2020.07.30.228304. (in revision)

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2019

Aumer, D., Stolle, E.,Allsopp, M., Mumoki, F., Pirk, C. W. W., Moritz, R. F. A. (2019): A single SNP turns a social honey bee (Apis mellifera) worker into a selfish parasite. Molecular Biology and Evolution, 36(3): 516–526.

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Colgan, T., Fletcher, I., Arce, A., Gill, R., Ramos Rodrigues, A., Stolle, E., Chittka, L., Wurm, Y. (2019): Caste- and pesticide-specific effects of neonicotinoid pesticide exposure on gene expression in bumblebees. Molecular Ecology, 28(8): 1964–1974.

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Kapheim, K. M., Pan, H., Li, C., Blatti, C., Harpur, B. A., Ioannidis, P., Jones, B. M., Kent, C. F., Ruzzante, L., Sloofman, L., Stolle, E., Waterhouse, R. M., Zayed, A., Zhang, G., Wcislo, W. T. (2019): Draft genome assembly and population genetics of an agricultural pollinator, the solitary alkali bee (Halictidae: Nomia melanderi). G3, 9(3): 625–634.

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Stolle, E., Pracana, R., Howard, P., Paris, C. I., Brown, S. J., Castillo-Carrillo, C. A., Rossitter, S. J., Wurm, Y. (2019): Degenerative expansion of a young supergene. Molecular Biology and Evolution, 36 (3): 553–561.

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Bombus terrestris genome

2017

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