Das Leibniz-Institut zur Analyse des Biodiversitätswandels

ist ein Forschungsmuseum der Leibniz Gemeinschaft

Dr. Vera Zizka

Postdoc

Naturschutzökologie

Tel: +49 (0)228 9122 459

Fax: +49 (0)228 9122 212

E-Mail: v.zizka [at] leibniz-lib.de

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Projekte

2022

GIBBS (Ganzheitliches Biodiversitätsmanagement in der Baustoffindustrie)

Die Gewinnung von Massenrohstoffen wie Kies, Sand, Ton und Gips ist mit erheblichen Eingriffen in Ökosysteme verbunden. Das Projekt zielt darauf ab, Biodiversität in den Abbaustätten der Baustoffindustrie zu erhalten und zu fördern. Am ZBM wird dabei ein systematisches Biodiversitätsmonitoring aufgebaut, das im Unternehmenskontext der Baustoffindustrie anwendbar ist. Hierbei werden sowohl traditionelle Methoden der Biodiversitätserfassung als auch technologiegetriebene Methoden eingesetzt.

Abteilung/Sektion:

Zentrum für Biodiversitätsmonitoring und Naturschutzforschung (zbm), Naturschutzökologie, Experimentelle und Angewandte Ökologie

Projektleitung:

Prof. Dr. Christoph Scherber

2019

DINA – Diversity of Insects in Nature Protected Areas

Vor dem Hintergrund des in Deutschland dokumentierten dramatischen Insektenrückgangs in Naturschutzgebieten wurde das Projekt DINA (Diversität von Insekten in Naturschutz-Arealen) entwickelt. In einem multidisziplinären Ansatz werden naturwissenschaftliche Ergebnisse mit sozio-ökonomischen Aspekten und der Perspektive von relevanten Teilhabern integriert.

Abteilung/Sektion:

Naturschutzökologie, Metabarcoding, Herpetologie, Zentrum für Biodiversitätsmonitoring und Naturschutzforschung (zbm)

Projektleitung:

Dr. Livia Schäffler

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

Publikationen

Publiziert in

2024

Zizka, V.M.A., Langen, K., Kirse, A., Scherges, A.M., Bourlat, S.J. (2024) Non-destructive DNA extraction and metabarcoding of arthropod bulk samples: a step-by-step protocol. In: Wägele, J.W., Tschan, G.F. (Eds) Weather stations for biodiversity: a comprehensive approach to an automated and modular monitoring system. Advanced Books, Pensoft, 87-102. https://doi.org/10.3897/ab.e119534

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2023

Sickel W., Zizka V., Scherges A., Bourlat S.J., Dieker P. (2023) Abundance estimation with DNA metabarcoding – recent advancements for terrestrial arthropods. Metabarcoding and Metagenomics 7: e112290. https://doi.org/10.3897/mbmg.7.112290

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Hörren T., Bodingbauer S., Bourlat S., Grüneberg C., Kaiser M., Kiel E.F., Schäffler L. , Scherber C., Schwan H., Seitz A., Stenmans W., Sumser H., Zizka V., Sorg M. (2023) Monitoring der Biodiversität flugaktiver Insekten in NRW. Nat NRW 3(2023):17–21

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Brasseur, M.V., Martini, J., Wilfling, O., Wüthrich, R., Birnstiel, E., Oester, R., Zizka, V.M.A., Singer, G., Leese, F., Vitecek, S., 2023. Exploring macroinvertebrate biodiversity in the dynamic southern Balkan stream network of the Vjosa using preservative-based DNA metabarcoding. Aquat Sci 85, 51. https://doi.org/10.1007/s00027-023-00948-w

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2022

Hörren T., Sorg M., Hallmann C. A., Zizka V. M. A., Ssymank A., Noll N. W., Schäffler L., Scherber C. (2022) A universal insect trait tool (ITT, v1.0) for statistical analysis and evaluation of biodiversity research data. bioRxiv:2022.2001.2025.477751.

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Links:

https://doi.org/10.1101/2022.01.25.477751

Kirse, A., Bourlat, S. J., Langen, K., Zapke, B., & Zizka, V. M. A. (2022). Comparison of destructive and nondestructive DNA extraction methods for the metabarcoding of arthropod bulk samples. Molecular Ecology Resources, 00, 1– 14.

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Köthe S., Schneider F. D., Bakanov N., Brühl C. A., Eichler L., Fickel T., Gemeinholzer B., Hörren T., Lux A., Meinel G., Schäffler L., Scherber C., Sorg M., Swenson S. J., Terlau W., Turck A., Zizka V. M. A., Lehmann G. U. C., Mühlethaler R. (2022) Improving insect conservation management through insect monitoring and stakeholder involvement. Biodiversity and Conservation

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Links:

https://doi.org/10.1007/s10531-022-02519-1

van Klink, R., August, T., Bas, Y., Bodesheim, P., Bonn, A., Fossøy, F., Høye, T. T., Jongejans, E., Menz, M. H. M., Miraldo, A., Roslin, T., Roy, H. E., Ruczyński, I., Schigel, D., Schäffler, L., Sheard, J. K., Svenningsen, C., Tschan, G. F., Wäldchen, J., Zizka, V. M. A., Åström, J., Bowler, D. E. (2022): Emerging technologies revolutionise insect ecology and monitoring. - Trends in Ecology & Evolution 37 (10): 872-885.

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Links:

https://doi.org/10.1016/j.tree.2022.06.001

Zizka, V.M.A., Koschorreck, J., Khan, C.C., Astrin, J.J. (2022): Long-term archival of environmental samples empowers biodiversity monitoring and ecological research. - Environmental Sciences Europe 34, 40.

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Links:

https://doi.org/10.1186/s12302-022-00618-y

Zizka, V. M., Geiger, M. F., Hörren, T., Kirse, A., Noll, N. W., Schäffler, L., Scherges, A. M., Sorg, M. (2022): Repeated subsamples during DNA extraction reveal increased diversity estimates in DNA metabarcoding of Malaise traps. - Ecology and Evolution, 12(11), e9502.

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2021

Elbrecht V, Bourlat SJ, Hörren T, Lindner A, Mordente A, Noll NW, Schäffler L, Sorg M, Zizka VMA. 2021. Pooling size sorted Malaise trap fractions to maximize taxon recovery with metabarcoding. PeerJ 9:e12177 https://doi.org/10.7717/peerj.12177

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Leese F., Sander M., Buchner D., Elbrecht V., Haase P., Zizka V.M.A. (2021). Improved freshwater macroinvertebrate detection from environmental DNA through minimized nontarget amplification. Environmental DNA, 00:1-16. DOI: 10.1002/edn3.177

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Lehmann, G.U.C., Bakanov, N., Behnisch, M., Bourlat, S.J., Brühl, C.A., Eichler, L., Fickel, T., Geiger, M.F., Gemeinholzer, B., Hörren, T., Köthe, S., Lux, A., Meinel, G., Mühlethaler, R., Poglitsch, H., Schäffler, L., Schlechtriemen, U., Schneider, F.D., Schulte, R., Sorg, M., Sprenger, M., Swenson, S.J., Terlau, W., Turck, A. & Zizka, V.M.A. Diversity of Insects in Nature protected Areas (DINA): an interdisciplinary German research project. Biodivers. Conserv. (2021). https://doi.org/10.1007/s10531-021-02209-4

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Links:

Diversity of Insects in Nature protected Areas (DINA): an interdisciplinary German research project

2020

Leese, F., Beermann, A.J., Zizka, V. unter Mitarbeit von Astrin, J., Bálint, M., Bourlat, S., Buchner, D., Elbrecht, V., Hörren, T., Krehenwinkel, H., Monaghan, M., Morinière, J., Pauls, S.U., Schäffler, L., Weigand, A. 2020 Potenzial genetischer Methoden für die Erfassung und das Monitoring von Insekten. Ausarbeitung im Rahmen des F+E-Vorhabens „Konzeptentwicklung zum bundesweiten Insektenmonitoring"

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Schäffler, L., Zizka, V. & Noll, N. (2020): Sektion Umweltbiologie am Zentrum für Biodiversitätsmonitoring (zbm) - Mitteilungen der Fachgruppe Umweltchemie und Ökotoxikologie der Gesellschaft Deutscher Chemiker, 26. Jahrgang Juni 2020

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Zizka, V.M.A., Weiss, M., Leese, F. (2020) Can metabarcoding resolve intraspecific genetic diversity changes to environmental stressors? A test case using river macrozoobenthos. - Metabarcoding and Metagenomics 4:23-34.

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Laini, A., Beermann A. J., Bolpagni R., Burgazzi G., Elbrecht V., Zizka V. M. A., Leese F., Viaroli P. (2020) Exploring the potential of metabarcoding to disentangle macroinvertebrate community dynamics in intermittent streams. - Metabarcoding and Metagenomics 4:65-79.

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Beermann, A. J., Werner, M-T., Elbrecht, V., Zizka, V. M. A., Leese F (2020): DNA metabarcoding improves the detection of multiple stressor responses of stream invertebrates to increased salinity, fine sediment deposition and reduced flow velocity. - Science of The Total Environment 750.

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Elbrecht, V., Bourlat, S.J., Lindner, A., Mordente, A., Noll, N., Sorg, M., Zizka, V. (2020) Pooling size sorted malaise trap fractions to maximise taxon recovery with metabarcoding. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.06.09.118950v1

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Zizka, V.M.A., Geiger, M.F., Leese, F. (2020): DNA metabarcoding of stream invertebrates reveals spatio-temporal variation but consistent status class assessments in a natural and urban river, Ecological Indicators, Volume 115, 106383. https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2020.106383.

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Seiten

ab 2020 wissenschaftliche Mitearbeiterin DINA Projekt, Forschungsmuseum Alexander Koenig, Bonn.

2016 - 2019 Promotion "Development and validation of DNA metabarcoding for stream macroinvertebrate community assessment", Universität Duisburg-Essen, Aquatische Ökosystemforschung.

2015 Praktikum "Screening for the ancient polar bear mitochondrial genome reveals low integration of mitochondiral pseudogenes (numts) in bears", Prof. Dr. Axel Janke, Evolutionäre Genomik, Senckenberg Biodiversität und Klima-Forschungszentrum (BiK-F), Frankfurt.

2014 Praktikum "Molecular systematic analyses of the Prasophyllinae (Diurideae, Orchidoideae, Orchidaceae)", Dr. Katharina Schulte, Tropical Herbarium, Cairns, Australia.

2013 - 2015 Master Ökologie und Evolution, Goethe Universität Frankfurt; Abschlussarbeit "Parasite diversity of Antarctic crocodile icefishes (Channichthyidae) from the South Shetland Islands", Prof. Dr. Sven Klimpel, Integrative Parasitologie und Zoophysiologie.

2009 - 2013 Bachelor Biowissenschaften, Goethe Universität Frankfurt und Universität Tromsø; Abschlussarbeit "On the behaviour of the Aye-Aye (Daubentonia madagascariensis)", Prof. Dr. Manfred Niekisch, Zoologischer Garten Frankfurt.

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