Das Leibniz-Institut zur Analyse des Biodiversitätswandels

ist ein Forschungsmuseum der Leibniz Gemeinschaft

Simone Behrens-Chapuis

Doktorandin

Ichthyologie

Tel: +49 (0)228 9122 431

Fax: +49 (0)228 9122 212

E-Mail: sichapuis [at] t-online.de

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Aufgabenbereiche

Im Rahmen meiner Dissertation untersuche ich am Beispiel der Süßwasserfauna – Fische und Makrozoobenthos – der Sieg die potentiellen Vorteile bei der Genauigkeit der taxonomischen Bestimmung sowie bei der Bearbeitungszeit von Proben, wenn verschiedene DNA Barcoding Ansätze Fließgewässermonitoring ergänzen.

Forschungsinteressen

DNA Barcoding, Biodiversitätsmonitoring, Süßwasserfauna, aquatische Ökologie, Systematik und Taxonomie, Morphologie

Weitere Informationen

Forschungsreise:

05/2010 – 08/2010

Feldaufenthalt in Soroako, Sulawesi (Indonesien) – Datenaufnahme für die Masterarbeit.

Weitere Tätigkeiten:

Seit 2014

Wissenschaftliche Hilfskraft im Rahmen des GBOL-Projekts

2011 – 2012

Wissenschaftliche Hilfskraft in der Sektion Ichthyologie (Georeferenzierung)

2008 – 2010

Studentische Hilfskraft in der Sektion Ichthyologie (Sammlungsdigitalisierung sowie Bestandskontrolle)

Projekte

2018

Evaluating the efficiency of different DNA-barcoding approaches for routine stream monitoring tasks

The focus of this project is to evaluate exemplary for the freshwater fauna of the river Sieg (Germany) the efficiency of different single specimen DNA-barcoding approaches for routine stream monitoring tasks.The taxonomic resolution of morphological and DNA barcode-based species identification is directly compared, investigating additional value and congruence of both methods. In cases where standard COI barcodes failed to offer unambiguous species identifications, the discrimination capacity of the nuclear rhodopsin marker (RHO) is tested.

Abteilung/Sektion:

Ichthyologie

Projektleitung:

PD Dr. Fabian Herder

2011

GBOL- German Barcode of Life

German Barcode of Life ( GBOL ) ist ein vom BMBF gefördertes Projekt zur Inventarisierung und genetischen Charakterisierung der Tiere, Pflanzen und Pilze Deutschlands anhand von DNA-Barcodes.

Projektleitung:

Prof. Dr. J. Wolfgang Wägele

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

FREDIE Projekt

Morphologische und molekulare Erfassung sämtlicher Arten von Fischen, Mollusken und Eintagsfliegen des Süßwassers in Europa.

Abteilung/Sektion:

Ichthyologie, Biodiversitätsinformatik, Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung (zmb), Theriologie

Projektleitung:

PD Dr. Fabian Herder

Finanzierung:

Leibniz-Gemeinschaft

Publikationen

2018

Behrens-Chapuis, S., Malewski, T., Suchecka, E., Geiger, M.F., Herder, F., Bogdanowicz, W. (2018): Discriminating European cyprinid specimens by barcode high-resolution melting analysis (Bar-HRM) – A cost efficient and faster way for specimen assignment? Fisheries Research, 204, 61-73.

2015

Behrens-Chapuis, S., Herder, F., Esmaeili, H.R., Freyhof, J., Hamidan, N.A., Özuluğ, M., Šanda, R., Geiger, M.F. Adding nuclear rhodopsin data where COI-based barcoding fails – from no benefit at all to the solution of a taxonomic conflict. DNA Barcodes, 3: 187–199.

2013

Pfaender, J., Gray, S. M., Rick, I. P., Chapuis, S., Hadiaty, R. K., & Herder, F. (2013). Spectral data reveal unexpected cryptic colour polymorphism in female sailfin silverside fish from ancient Lake Matano. Hydrobiologia, 1-7.

2012

Gawor, A., Chapuis, S., Pham, C. T., Nguyen, T. Q., Schmitz, A., Ziegler, T. (2012) Larval morphology of two species of the genus Theloderma (Tschudi, 1838) from Vietnam (Anura: Rhacophoridae: Rhacophorinae) Zootaxa, 3395: 59-64.

2010

Herder, F., & Chapuis, S. (2010) Oryzias hadiatyae, a new species of ricefish (Atherinomorpha: Beloniformes: Adrianichthyidae) endemic to Lake Masapi, Central Sulawesi, Indonesia. Raffles Bulletin of Zoology, 58, 269-280.

Publiziert in

2021

Behrens-Chapuis, S., Herder, F., Geiger, M.F. (2021): Adding DNA barcoding to stream monitoring protocols – What’s the additional value and congruence between morphological and molecular identification approaches? - PLoS ONE 16(1): e0244598. https://doi.org/10.1371/journal. pone.0244598

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Links:

Zum Artikel

2018

Behrens-Chapuis, S., Malewski, T., Suchecka, E., Geiger, M.F., Herder, F., Bogdanowicz, W. (2018): Discriminating European cyprinid specimens by barcode high-resolution melting analysis (Bar-HRM)—A cost efficient and faster way for specimen assignment? Fisheries Research, Volume 204, August 2018, 61-73, ISSN 0165-7836, https://doi.org/10.1016/j.fishres.2018.02.007.

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2015

Behrens-Chapuis, S., Herder, F., Esmaeili, H.R., Freyhof, J., Hamidan, N.A., Özuluğ, M., Šanda, R., Geiger, M.F. Adding nuclear rhodopsin data where COI-based barcoding fails - from no benefit at all to the solution of a taxonomic conflict. DNA Barcodes 3: 187–199.

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2012

Gawor, A., Chapuis, S., Pham, C.T., Nguyen, Q.T., Schmitz, A., Ziegler, T. (2012) Larval morphology of two species of the genus Theloderma (Tschudi, 1838) from Vietnam. Zootaxa 3395: 59-64.

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2010

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Präsentationen

Vorträge

S. Chapuis, F. Herder, B. Rulik, M. F. Geiger (2017): „DNA Barcoding in der Anwendung – Eine Untersuchung der Süßwasserfauna des Sieg-Flusssystems“.

14. Tagung der Gesellschaft für Ichthyologie, Bonn, Germany.

S. Chapuis, F. Herder, M. F. Geiger, I. Steinmann (2012): „DNA Barcoding in der Anwendung – Eine Untersuchung der Fischgemeinschaft des Sieg-Flusssystems im Rahmen des GBOL-Projekts“. 9. Tagung der Gesellschaft für Ichthyologie, Düsseldorf.

Poster

S. Chapuis, M. F. Geiger, I. Steinmann, F. Herder (2013) DNA Barcoding in der Anwendung – Eine Untersuchung der Süßwasserfauna des Sieg-Fluss-Systems im Rahmen des GBOL-Projekts. 10. Tagung der Gesellschaft für Ichthyologie, Bonn.

S. Chapuis, R. M. Luetzenkirchen, I. P. Rick, S. A. Baldauf, J. Pfaender, F. Herder (2011) Der Farbpolymorphismus männlicher Sonnenstrahlfische (Telmatherinidae) des Matanosees – eine erste Analyse. 8. Tagung der Gesellschaft für Ichthyologie, Frankfurt am Main, Deutschland.

S. Chapuis, F. Herder (2009) Morphological variation in stream- dwelling sailfin silversides (Atheriniformes: Telmatherinidae) of the Malili Lakes system, Sulawesi (Indonesia). 6th International Tropical Biology Symposium, Bonn.

M. Hiermes, R. Modarressie, S. Chapuis, M. Wildenhues, T. C. M. Bakker (2009)

Habitat-dependent olfactory population recognition in three-spined sticklebacks (Gasterosteus aculeatus). Deutsche Zoologische Gesellschaft 102. Annual Meeting,

Regensburg.

S. Chapuis, F. Herder (2008) A morphometric approach to test for local differentiation in stream- dwelling sailfin silversides (Atheriniformes: Telmatherinidae) of the Malili lakes system, Sulawesi (Indonesia). 6. Tagung der Gesellschaft für Ichthyologie, München, Deutschland.

Seit 2012

Promotionsprojekt: " Evaluating the efficiency of single specimen DNA barcoding approaches for routine stream monitoring tasks – an application study with the River Sieg freshwater fauna”

Betreuer: PD Dr. Fabian Herder

2011

Master of Science in “Organismic Biology, Evolutionary Biology and Palaeobiology” (OEP) an der Friedrich Wilhelms- Universität Bonn.

Thema: “Male colour polymorphisms and fitness correlates in Lake Matano’s “roundfin” sailfin silverside fish radiation”.

2008

Bachelor of Science in Biologie an der Universität zu Köln.

Thema: “Morphometric and meristic analysis of sailfin silversides (Teleostei: Atheriniformes) inhabiting streams and rivers of the Malili Lakes system in Central Sulawesi, Indonesia”.

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