Dr. Karen Meusemann

Wissenschaftliche Forschungsreferentin

Direktionsstab

Tel: +49 (0)228 9122 307

Fax: +49 (0)228 9122 212

E-Mail: k.meusemann [at] leibniz-lib.de

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Profil

Aufgabenbereiche

Seit Anfang April 2021 arbeite ich als Forschungsreferentin am LIB (Museum Koenig Bonn). Meine Bereiche umfassen den internen Austausch im LIB zwischen den Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern zwischen den verschiedenen Standorten in Bonn und zwischen Bonn und Hamburg, Organisation, Unterstützung von Projekten, Zuarbeit der Direktion und des Direktionsstabs, Gremienarbeit & Berichtswesen, Unterstützung der Graduiertenschule, Etablierung und Unterstützung unseres Mentoring-Programms u.a. Darüber hinaus bin ich an verschiedensten Projekten inhaltlich aktiv im LIB beteiligt (1KITE, Evolution der Reisfische, Molekulare Methoden, Evolution der Dexiarchia, etc.)

Meine wissenschaftlichen Schwerpunkte liegen im Bereich der Phylogenomik und Transcriptomik diverser Insektengruppen ("Basale Hexapoden", Neuropterida, Mecoptera, Antliophora, Diptera). Besonders interessieren mich dabei die Etablierung neuer Methoden und kritische Evaluierung von Datensätzen.

Nach meiner Dlplomarbeit (Karyologie bei Bläulingen) war ich von 2005 - 2012 Doktorandin im DFG-SPP "Deep Metazoan Phylogeny" im zmb (Zentrum für Molekulare Biodiversitätsforschung, Betreuung: Prof. Dr. B. Misof) im Bereich der Molekularen Phylogenomik "basaler" Hexapoden und Myriapoden. Ich bin Mitbegründerin und Co-Koordination des internationalen 1KITE (www.kite.org) Projekts mit den Schwerpunkten Phylogenomik bei Insekten und Methodenentwicklung (Transcriptomik). Nach Arbeit an der Phylogenomik von Dipteren & Antliophora (Fliegen, Flöhe, Skorpionsfliegen) von 2013 - 2016 an der Australian National Insect Collection (CSIRO, Canberra) war ich von 2016 - 2021 Wissenschaftliche Koordinatorin der DFG Forschergruppe FOR2281 (Sociality and the reversal of the fecundity-longevity trade-off: www.so-long.org) in der AG Prof. Dr. J. Korb an der Universität Freiburg.

Forschungsinteressen

Projekt- und Wissenschaftsmanagement und Projektkoordination und Organisation im Bereich der Biodiversitätsforschung, Science-Policy Interaktionen, Molekulare Evolution, Phylogenomik, Hexapoden, Speziation, Hybridisierung, Systematik & Taxonomie, Methodenentwicklung

Mitgliedschaften

Deutsche Zoologische Gesellschaft (DZG), Gesellschaft für Biologische Systematik (GfBS)

Auszeichnungen

Dissertations-Preis der AKG

Weitere Profile im Netz

http://www.meusemann.de/

https://scholar.google.com/citations?user=uK45QqgAAAAJ&hl=de

https://www.researchgate.net/profile/Karen-Meusemann

https://twitter.com/karenmeusemann

https://linkedin.com/in/karen-meusemann

Projekte

2020

SIGI

SIGI nutzt neue genomische Methoden & Tools, um die Ökologie und Evolution von wirbellosen Bodenlebewesen, ihre Rolle in Ökosystemen und Bodenfunktionen zu verstehen, nachhaltige Bewirtschaftungsverfahren zu entwickeln und Ressourcen für die Bioökonomie bereitzustellen.Das Projekt ist ein Kollaborationsprojekt mit dem LOEWE Zentrum für Translationale Biodiversitätsgenomik (Leitung: M. Balint, Senckenberg). Photo: German Pauropod, Andy Murray.

Abteilung/Sektion:

Direktionsstab

Projektleitung:

Dr. Karen Meusemann

2017

AG RICEFISH

Kern des Projekts ist die Verknüpfung von evolutiv bedeutenden Merkmalen und dem dazugehörigen genetischen Hintergrund. Die Forschergruppe untersucht eine einzigartige Fortpflanzungsstrategie, die bei einigen Arten von Reisfischen der Gattung Oryzias (Actinopterygii: Adrianichthyidae) von der südost-asiatischen Insel Sulawesi (Indonesien) zu finden ist: das sogenannte Bauchflossenbrüten. Hierbei tragen die Weibchen die Eier mit speziellen morphologischen Strukturen bis zum Schlupf eng am Körper.

Abteilung/Sektion:

Evolutionäre Genomik, Zentrum für Taxonomie und Morphologie (ztm), Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung (zmb), Direktion, Lehrstuhl Spezielle Zoologie, Ichthyologie, Direktionsstab

Projektleitung:

Dr. Julia Schwarzer

Finanzierung:

Leibniz-Gemeinschaft, Alexander-Koenig-Gesellschaft e.V.

Evolution der Dexiarchia

Die Meeresschnecken der Untergruppe Dexiarchia umfassen weltweit mindestens 2000 Arten und viele noch unbeschriebene Spezies. Bis heute existiert keine umfassende phylogenetische Analyse der Dexiarchia, welche alle Hauptgruppen und deren Verwandtschaftsbeziehungen zueinander behandelt. Dieses Projekt soll dieses fundamentale Problem mit genomischen Daten lösen.

Abteilung/Sektion:

Bioinformatische Genomik, Phylogenetik und Evolutionsbiologie, Morphologielabor, Lehrstuhl Molekulare Biodiversitätsforschung

Projektleitung:

Dr. Alexander Donath

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

2014

Phylogenie der Holometabola

Die Holometabola sind die Insekten mit vollständiger Umwandlung (Larve, Puppe, erwachsenes Tier) und stellen über 60% der beschriebenen Tierarten. Das Projekt versucht die offenen Fragen im Stammbaum dieser Gruppe zu lösen.

Abteilung/Sektion:

Hymenoptera, Direktionsstab

Projektleitung:

Dr. Ralph S. Peters

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

2012

MARE

In der Phylogenomik werden häufig Charaktermatrizen mit umfangreich fehlenden Daten verwendet. Diese fehlenden Daten haben möglicherweise nachteilige Auswirkungen auf die Genauigkeit und Robustheit der Bauminferenz. Daher wählen viele Forscher Taxa und Gene mit hoher Datenabdeckung.

Abteilung/Sektion:

Direktion, Lehrstuhl Spezielle Zoologie, Direktionsstab

Projektleitung:

Prof. Dr. Bernhard Misof

1KITE: Die Evolution der Insekten

1KITE ist ein internationales Forschungsprojekt, das die Evolutionsgeschichte der Insekten versucht in bisher nicht dagewesenem Umfang nachzuzeichnen. Ein wesentliches Ziel dieses Projektes ist die Rekonstruktion des Stammbaums der Insekten. Ein solcher ist Voraussetzung, um die mannigfaltigen Anpassungen der Insekten an ihre Umwelt im Laufe der Erdgeschichte besser verstehen zu können. Darüber hinaus können die gewonnenen Erkenntnisse aber auch für die Entwicklung von neuen Arzneimitteln oder Schädlingsbekämpfungsmitteln von großer Bedeutung sein. Zu diesem Zweck ist es vorgesehen, bis Ende…

Abteilung/Sektion:

Direktion, Lehrstuhl Spezielle Zoologie, Direktionsstab, Statistische Phylogenetik und Phylogenomik, Personalrat, Bioinformatische Genomik, Hochleistungsrechner, Phylogenetik und Evolutionsbiologie, Hymenoptera, Biodiversitätsinformatik, Biobank, Morphologielabor, Lehrstuhl Molekulare Biodiversitätsforschung, Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung (zmb)

Projektleitung:

Prof. Dr. Bernhard Misof

ALISCORE - Masking of…

Zufällige Ähnlichkeit der Sequenzen oder Sequenzabschnitte können phylogenetische Analysen oder die Identifikation von Gen-Homologien behindern.

Abteilung/Sektion:

Direktion, Lehrstuhl Spezielle Zoologie, Algorithmen-Entwicklung, Direktionsstab, Biodiversitätsinformatik

Projektleitung:

Prof. Dr. Bernhard Misof

2009

Die Atelocerata - Eine…

Berlese-Fallen

Abteilung/Sektion:

Direktion, Lehrstuhl Spezielle Zoologie, Direktionsstab

Projektleitung:

Prof. Dr. Bernhard Misof

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

Publikationen

Eine vollständige Publikationsliste findet sich bei Google Scholar

Publiziert in

2023

Flury JM, Meusemann K, Martin S, Hilgers L, Spanke T, Böhne A, Herder F, Mokodongan D, Altmüller J, Wowor D, Misof B, Nolte AW, Schwarzer J. (2023) Potential contribution of ancient introgression to the evolution of a derived reproductive strategy in ricefishes. Genome Biology and Evolution: evad138, doi: 10.1093/gbe/evad138

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Links:

Potential contribution of ancient introgression to the evolution of a derived reproductive strategy in ricefishes.

2022

Kück, P., Romahn, J., Meusemann, K. (2022): Pitfalls of the site-concordance factor (sCF) as measure of phylogenetic branch support. - NAR Genomics and Bioinformatics. Accepted.Ro

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Möckel, L., Meusemann, K., Misof, B., Schwartze, V.U, De Fine Licht, H., Voigt, K., Stielow, B, de Hoog, S., Beutel, R.G., Buellesbach, J. (2022). Phylogenetic revision and patterns of host specificity in the fungal subphylum Entomophthoromycotina. - Microorganisms. Accepted. DOI: https://doi.org/10.3390/xxxxx

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2021

Bayless, K. M., Trautwein, M. D., Meusemann, K., Petersen, M., Shin, S., Donath, A., Podsiadlowski, L., Mayer, C., Niehuis, O., Peters, R. S., Meier, R., Kutty, S. N., Liu,S., Zhou, X., Misof, B., Yeates, D. K., Wiegmann, B. M. (2021): Beyond Drosophila: resolving the rapid radiation of schizophoran flies with phylotranscriptomics. - BMC Biology 19: 1-17. https://doi.org/10.1186/s12915-020-00944-8.

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Links:

https://doi.org/10.1186/s12915-020-00944-8

Karmeinski, D., Meusemann, K., Goodheart, J. A., Schroedl, M., ..., Wägele, H., Donath, A. (2021): Transcriptomics provides a robust framework for the relationships of the major clades of cladobranch sea slugs (Mollusca, Gastropoda, Heterobranchia), but fails to resolve the position of the enigmatic genus Embletonia. - BMC Ecolology and Evolution 21: 226. https://doi.org/10.1186/s12862-021-01944-0.

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Links:

https://doi.org/10.1186/s12862-021-01944-0

Korb, J., Meusemann, K., Aumer, D., Bernadou, A. , ..., Paxton, R. J., Séguret Alice C., ... Flatt, T. et al. (2021): Comparative transcriptomic analysis of the mechanisms underpinning ageing and fecundity in social insects. - Philosophilcal Transactions of the Royal Society B. 376:20190728. http://doi.org/10.1098/rstb.2019.0728.

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Links:

http://doi.org/10.1098/rstb.2019.0728

Kramer, B. H., Nehring, V., Buttstedt, A., Heinze, J., Korb, J., Libbrecht, R., Meusemann, K., Paxton R. J., et al. (2021): Oxidative stress and senescence in social insects: a significant but inconsistent link? - Philosophical Transactions of the Royal Society B 376:20190732. http://doi.org/10.1098/rstb.2019.0732.

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Links:

http://doi.org/10.1098/rstb.2019.0732

Monroy Kuhn, J. M., Meusemann, K., Korb, J. (2021): Disentangling the aging gene expression network of termite queens. - BMC Genomics 22: 339. https://doi.org/10.1186/s12864-021-07649-4.

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Links:

https://doi.org/10.1186/s12864-021-07649-4

Pauli, T., Meusemann, K., Kukowka, S., Sann, M., Donath, A., Mayer C., Oeyen, J.P., ..., Podsiadlowski, L., ..., Misof, B., Peters, R.S., et al. (2021): Analysis of RNA-Seq, DNA Target Enrichment, and Sanger Nucleotide Sequence Data Resolves Deep Splits in the Phylogeny of Cuckoo Wasps (Hymenoptera: Chrysididae). - Insect Systematics and Diversity 5: 1. https://doi.org/10.1093/isd/ixaa018.

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Links:

https://academic.oup.com/isd/article/5/1/1/6061886
https://doi.org/10.1093/isd/ixaa018

Sann, M., Meusemann, K., Niehuis, O., Escalona, H. E., Mokrousov, M., Ohl, M., Pauli, T., Schmid-Egger, C. (2021): Reanalysis of the apoid wasp phylogeny with additional taxa and sequence data confirms the placement of Ammoplanidae as sister to bees. - Systematic Entomology 46: 558-569. https://doi.org/10.1111/syen.12475.

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Links:

https://doi.org/10.1111/syen.12475

Séguret, A. C., Stolle, E., Fleites-Ayil, F. A., Quezada-Euán, J. J. G., Hartfelder, K., Meusemann, K., Harrison, M., et al. (2021): Transcriptomic signatures of ageing vary in solitary and social forms of an orchid bee. - Genome Biology and Evolution 13 (6): evab075. https://doi.org/10.1093/gbe/evab075.

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Links:

https://doi.org/10.1093/gbe/evab075

Stringer, D. N., Bertozzi, T., Meusemann, K., Delean, S., Guzik, M. T., Tierney, S. M., Mayer, C., Cooper, S. J. B., Javidkar, M., Zwick, A., Austin, A. D. (2021): Development and evaluation of a custom bait design based on 469 single-copy protein-coding genes for exon capture of isopods (Philosciidae: Haloniscus). - PLOS ONE 16 (9): e0256861. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0256861.

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Links:

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0256861

Vasilikopoulos, A., Balke, M., Kukowka, S., Pflug, J. M., Martin, S., Meusemann, K., Hendrich, L., Mayer, C., Maddison, D. R., Niehuis, O., Beutel, R. G. Misof, B. (2021): Phylogenomic analyses clarify the pattern of evolution of Adephaga (Coleoptera) and highlight phylogenetic artefacts due to model misspecification and excessive data trimming. - Systematic Entomoly 46: 991-1018. https://doi.org/10.1111/syen.12508.

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Links:

https://doi.org/10.1111/syen.12508

Yan, L., Pape, T., Meusemann, K., Kutty, S. N., Meier, R., Bayless, K. M., Zhang, D. (2021): Monophyletic blowflies revealed by phylogenomics. - BMC Biololgy 19: 230. https://doi.org/10.1186/s12915-021-01156-4.

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Links:

https://doi.org/10.1186/s12915-021-01156-4

2020

Song, H., Béthoux, O., Shin, S., Donath, A., Letsch, H., Liu, S., McKenna, D., Meng, G., Meusemann, K., Misof, B., Podsiadlowski, L., Zhou, X., Wipfler, B., Simon, S. (2020). Phylogenomic analysis sheds new light on the evolutionary pathways towards acoustic communication in Orthoptera. Nature Communications 11: 4939

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Szucsich, N.U., Bartel, D., Blanke, A., Böhm, A., Donath, A., Fukui, M., Grove, S., Liu, S., Macek, O., Machida, R., Misof, B., Nakagaki, Y., Podsiadlowski, L., Sekiya, K., Tomizuka, S., Reumont, B.v., Waterhouse, R., Walzl, M., Meng, G., Zhou, X., Pass, G., Meusemann, K. (2020). Four myriapod relatives – but who are sisters? No end to debates on relationships among the four major myriapod subgroups. BMC Evol Biology 20: 144

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2019

Evangelista, D.A., Wipfler, B., Bethoux, O., Donath, A., Fujita, M., Kohli, M.K., Legendre, F., Liu, S., Machida, R., Misof, B., Peters, R.S., Podsiadlowski, L., Rust, J., Schuette, K., Tollenaar, W., Ware, J.L., Wappler, T., Zhou, X., Meusemann, K., Simon, S. (2019) An integrative phylogenomic approach illuminates the evolutionary history of cockroaches and termites (Blattodea). Proceedings of the Royal Society B 286: 20182076

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Vasilikopoulos, A., Balke, M., Beutel, R.G., Donath, A., Podsiadlowski, L., Pflug, J.M., Waterhouse, R.M., Meusemann, K., Peters, R.S., Escalona, H.E., Mayer, C., Liu, S., Hendrich, L., Alarie, Y., Bilton, D.T., Jia, F., Zhou, X., Maddison, D.R., Niehuis, O., Misof, B., (2019): Phylogenomics of the superfamily Dytiscoidea (Coleoptera: Adephaga) with an evaluation of phylogenetic conflict and systematic error. Molecular Phylogenetics and Evolution. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2019.02.022

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2018

Rakitov, R., Moysa, A.A., Kopylov, A.T., Moshkovskii, S.A., Peters, R.S., Meusemann, K., Misof, B., Dietrich, C.H., Johnson, K.P., Podsiadlowski, L., Walden, K.KO. (2018): Brochosomins and other novel proteins from brochosomes of leafhoppers (Insecta, Hemiptera, Cicadellidae). Insect Biochemistry and Molecular Biology 94, 10-17. https://doi.org/10.1016/j.ibmb.2018.01.001

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Pauli, T., Burt, T., Meusemann, K, Bayless, K,. Donath, A., Podsiadlowski, L., Mayer, C., Kozlov, A., Vasilikopoulos, A., Liu, S., Zhou, X., Yeates, D., Misof, B., Peters, R.S., and Mengual, X. (2018): New data, same story: phylogenomics does not support Syrphoidea (Diptera: Syrphidae, Pipunculidae). Systematic Entomology 43(3), 447–459.

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Documents:

2018_syrphoidea.pdf

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Kurzer Wissenschaftl. Werdegang

seit 04/2021: Wissenschaftliche Forschungsreferentin am Leibniz-Institute zur Analyse des Biodiversitätswandels - Zool. Forschungsmuseum A. Koenig, Bonn
05/2016 - 03/2021: Wissenschaftl. Koordinatorin der Forschergruppe FOR 2281 (www.so-long.org) and Postdoc an der Universität Freiburg, Evolutionsbiologie & Ökologie (AG Korb), Freiburg (Brsg.)
07/2013 – 04/2016: Postdoctoral Fellow (Schlinger) an der Australian National Insect Collection, CSIRO, National Research Collections Australia, Canberra, ACT, Australia
03/2012 – 06/2013: Postdoctoral Fellow (DFG) am Zentrum für Molekulare Biodiversitätsforschung (zmb), Zool. Forschungsmuseum A. Koenig (ZFMK), Bonn
03/2012: Dr. rer. nat. (summa cum laude), Zentrum für Molekulare Biodiversitätsforschung (zmb), Zool. Forschungsmuseum A. Koenig (ZFMK), Bonn
seit 2012: Aktives Gründungsmitglied & Co-Koordinatorin von 1KITE (www.1kite.org): Koordination, Organisation, Datenanalyse, Leitung des Subprojekts "Basal Hexapods"
2006 – 2012: Doktorandin am Zentrum für Molekulare Biodiversitätsforschung (zmb), Zool. Forschungsmuseum A. Koenig (ZFMK), Bonn. Ph.D. thesis: Molecular phylogeny and evolution of ’basal hexapods’: The “Atelocerata” - A vanishing hypothesis? (DFG priority program SPP1174 “Deep Metazoan Phylogeny”). Supervisor: Prof. Dr. B. Misof. Published online: https://bonndoc.ulb.uni-bonn.de/xmlui/handle/20.500.11811/5363

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