Das Leibniz-Institut zur Analyse des Biodiversitätswandels

ist ein Forschungsmuseum der Leibniz Gemeinschaft

Dr. Lars Podsiadlowski

Leiter (kommissarisch) Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung
Wissenschaftlicher Leiter des Molekularlabors am ZMB

Molekularlabor, Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung (zmb)

Tel: +49 (0)228 9122 356

Fax: +49 (0)228 9122 295

E-Mail: l.podsiadlowski [at] leibniz-zfmk.de

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Profil

Aufgabenbereiche

Seit Oktober 2017 bin ich als wissenschaftlicher Laborleiter am zmb beschäftigt. Neben der allgemeinen Betreuung des Labors bin ich vor allem zuständig für die Betreuung von Hochdurchsatz-Sequenzierungen von Genom-, Transkriptom und sammlungsbasierten Hybrid-Enrichment Projekten.

Forschungsinteressen

Evolution von Genomen, innerhalb einer Art (Populationsgenomik), zwischen nah verwandten Arten und höheren Taxa. Evolution von Genen und mobilen Elementen (Transposons).

Mitgliedschaften

Society for Molecular Biology and Evolution, Deutscher Hochschulverband, Deutsche Zoologische Gesellschaft, Society of Systematic Biologists

Projekte

2022

Untersuchung der genomischen und transkriptomischen Signaturen des globalen Wandels in einer marinen Fischart in Raum und Zeit

DFG Projekt in Kooperation mit Prof. Henrik Krehenwinkel (Projektleiter), Projektleitung Bonn: Dr. Christoph Mayer

Abteilung/Sektion:

Statistische Phylogenetik und Phylogenomik, Personalrat, Molekularlabor, Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung (zmb)

Projektleitung:

Dr. Christoph Mayer

2021

Der Karibische Würfelfalter

Die Würfelfalter, Riodinidae, sind eine der sechs Schmetterlingsfamilien. Die meisten ihrer 1300 Arten sind in der Neotropis beheimatet, eine einzige monotypische Gattung lebt jedoch auf den Westindischen Inseln. Der Karibische Würfelfalter, Dianesia carteri, ist auf Kuba und die Bahamas beschränkt, wo mehrere isolierte Populationen bekannt sind. Ein erster Ansatz unter Verwendung von DNA Barcodes deutet darauf hin, dass Dianesia möglicherweise mehr als eine Art umfasst.

Abteilung/Sektion:

Lepidoptera, Molekularlabor, Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung (zmb)

Projektleitung:

Dr. Rayner Nuñez

Finanzierung:

Alexander von Humboldt-Stiftung

2019

Einfluss von Landnutzung und Klimawandel auf äthiopische Frankoline

Diese Studie befasst sich mit zwei äthiopischen Frankolin-Arten und zielt auf umfassende Analysen von Schutzmaßnahmen und Landnutzungs-Management ab.

Abteilung/Sektion:

Ornithologie, Molekularlabor, Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung (zmb)

Projektleitung:

Abadi Mehari Abrha

Finanzierung:

Deutscher Akademischer Austauschdienst

Evolution der Ninetinae

Dieses Projekt befasst sich mit den Ninetinae, einer Unterfamilie der Zitterspinnen. Es handelt sich um winzige bodenlebende Tiere die überwiegend auf aride Gegenden beschränkt sind. Im phylogenetischen System der Zitterspinnen scheinen sie eine ‚basale‘ Stellung einzunehmen, so dass sie entscheidend sind für das Verständnis der Evolution der Zitterspinnen.

Abteilung/Sektion:

Arachnida, Molekularlabor

Projektleitung:

Dr. Bernhard A. Huber

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

Morphologie und Phylogenie der Schaben und Termiten

Die etwa 7500 Arten der Schaben und Termiten werden in dem Taxon Blattodea zusammengefasst. Ziel des Projektes ist die Klärung der Verwandtschaftsverhältnisse zwischen den einzelnen Teilgruppen der Blattodea, die Datierung der wichtigsten Aufspaltungen. Ausserdem werden die Kopfmorphologie und die Funktionsmorphologie der Mundwerkzeuge untersucht.

Abteilung/Sektion:

Morphologielabor, Bioinformatische Genomik, Molekularlabor, Hymenoptera, Direktion

Projektleitung:

Dr. Benjamin Wipfler

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

2018

Evolution der polyneopteren Insekten

Polyneoptera ist eine der vier Großgruppen der geflügelten Insekten und besteht aus elf traditionellen Ordnungen wie den Heuschrecken (Orthoptera), den Ohrkneifern (Dermaptera) oder den Schaben (Blattodea). Die Verwandtschaftsverhältnisse zwischen diesen Teilgruppen und damit auch wichtige evolutive Erergnisse wie zum Beispiel der Ursprung von Sozialverhalten, Habitatpräferenzen oder morphologische Anpassungen sind vollkommen ungeklärt. In dem hier vorgestellten Projekt wird durch eine Kombination von phylogenomischen Analysen und detailierten phenotypischen Daten das erste umfassende Bild der Evolution der polyneopteren Insekten entworfen.

Abteilung/Sektion:

Morphologielabor, Bioinformatische Genomik, Statistische Phylogenetik und Phylogenomik, Direktion, Hymenoptera, Graduiertenschule (GBR), Molekularlabor

Projektleitung:

Dr. Benjamin Wipfler

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

Apollo population genomics

Parnassius apollo (Papilionidae) is an iconic butterfly species with a wide distribution from Spain to China. The distribution is, however, very spotwise, and e.g. in Germany only a few populations remain. It is the only non-tropical butterfly protected under the CITES The goal of this project is to use whole genome sequencing to investigate the genetic diversity of Parnassius apollo across space and time. To do this we will use both fresh and museum specimens collected across the range of the species, and during the last 120 years.

Abteilung/Sektion:

Lepidoptera, Molekularlabor

Projektleitung:

Dr. Marianne Espeland

Finanzierung:

Zoologisches Forschungsmuseum Alexander Koenig

SPP Taxonomics

Abteilung/Sektion:

Coleoptera, Statistische Phylogenetik und Phylogenomik, Direktion, Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung (zmb), Lehrstuhl Molekulare Biodiversitätsforschung, Personalrat, Diptera, Molekularlabor, Arachnida, Lepidoptera, Myriapoda

Projektleitung:

Dr. Dirk Ahrens

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

Publikationen

Publiziert in

2018

Rakitov, R., Moysa, A.A., Kopylov, A.T., Moshkovskii, S.A., Peters, R.S., Meusemann, K., Misof, B., Dietrich, C.H., Johnson, K.P., Podsiadlowski, L., Walden, K.KO. (2018): Brochosomins and other novel proteins from brochosomes of leafhoppers (Insecta, Hemiptera, Cicadellidae). Insect Biochemistry and Molecular Biology 94, 10-17. https://doi.org/10.1016/j.ibmb.2018.01.001

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Peters, R.S., Niehuis, O., Gunkel, S., Bläser, M., Mayer, C., Podsiadlowski, L., Kozlov, A., Donath, A., van Noort, S., Liu, S., Zhou, X., Misof, B., Heraty, J., Krogmann, L., (2018): Transcriptome sequence-based phylogeny of chalcidoid wasps (Hymenoptera: Chalcidoidea) reveals a history of rapid radiations, convergence, and evolutionary success. Molecular Phylogenetics and Evolution. 120, 286–296. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2017.12.005

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Johnson, K.P., Dietrich, C.H., Friedrich, F., Beutel, R.G., Wipfler, B., Peters, R.S., Allen, J.M., Petersen, M., Donath, A., Walden, K.K.O., Kozlov, A.M., Podsiadlowski, L., Mayer, C., Meusemann, K., Vasilikopoulos, A., Waterhouse, R.M., Cameron, S.L., Weirauch, C., Swanson, D.R., Percy, D.M., Hardy, N.B., Terry, I., Liu, S., Zhou, X., Misof, B., Robertson, H.M., Yoshizawa, K., (2018): Phylogenomics and the evolution of hemipteroid insects. Proceedings of the National Academy of Sciences: 201815820.

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2017

Bank, S., Sann, M., Mayer, C., Meusemann, K., Donath, A., Podsiadlowski, L., Kozlov, A., Petersen, M., Krogmann, L., Meier, R., Rosa, P., Schmitt, T., Wurdack, M., Liu, S., Zhou, X., Misof, B., Peters, R.S., Niehuis, O., (2017): Transcriptome and target DNA enrichment sequence data provide new insights into the phylogeny of vespid wasps (Hymenoptera: Aculeata: Vespidae). Molecular Phylogenetics and Evolution 116, 213–226. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2017.08.020

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Petersen, M., Meusemann, K., Donath, A., Dowling, D., Liu, S., Peters, R.S., Podsiadlowski, L., Vasilikopoulos, A., Zhou, X., Misof, B., Niehuis, O. (2017): Orthograph: a versatile tool for mapping coding nucleotide sequences to clusters of orthologous genes. BMC Bioinformatics. 18(1), 111. https://doi.org/10.1186/s12859-017-1529-8

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Peters, R.S., Krogmann, L., Mayer, C., Donath, A., Gunkel, S., Meusemann, K., Kozlov, A., Podsiadlowski, L., Petersen, M., Lanfear, R., Diez, P.A., Heraty, J., Kjer, K.M., Klopfstein, S., Meier, R., Polidori, C., Schmitt, T., Liu, S., Zhou, X., Wappler, T., Rust, J., Misof, B., Niehuis, O. (2017): Evolutionary History of the Hymenoptera. Current Biology. 27, 1013–1018. https://doi.org/10.1016/j.cub.2017.01.027

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2014

Töpfer, T., Podsiadlowski, L., Gedeon, K. (2014): Rediscovery of the Black-fronted Francolin Pternistis (castaneicollis) atrifrons (Conover, 1930) (Aves: Galliformes: Phasianidae) with notes on biology, taxonomy and conservation. – Vertebrate Zoology 64: 261-271.

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Lehre

Wintersemester 2019/20

Bioinformatics for beginners (introduction to python language) (with A. Donath); Master OEP

Genomics and bioinformatics (with J. Schwarzer, M. Espeland); Master OEP

Evolution of mammals - Form and function (with E. Baermann, J. Decher, C. Montermann); Master OEP

Wintersemester 2018/19

Bioinformatics for beginners (introduction to python language) (with A. Donath); Master OEP

Genomics and bioinformatics; Master OEP

Evolution of mammals - Form and function (with E. Baermann, J. Decher, C. Montermann); Master OEP

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Apollo population genomics

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