Das Leibniz-Institut zur Analyse des Biodiversitätswandels

ist ein Forschungsmuseum der Leibniz Gemeinschaft

Molekularlabor

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Info

Das Molekularlabor des Zoologischen Forschungsinstitutes und Museum Alexander Koenig hat sich seit 1997 beständig zu einem wesentlichen Bestandteil des ZFMK - Forschungsbereiches entwickelt.

Die Voraussetzungen für genomische, populationsgenetische und phylogenetische Arbeiten sind bestens realisiert und werden in einer Vielzahl von Projekten genutzt.

Im Labor setzen wir PCR Techniken, Mikrosatellitenanalyse und Library Präparation für Hochdurchsatz-Sequenzierungen ein. Long-read Sequenzierung für genomische Analysen wird intensiv genutzt.

Ein wesentliches Ziel besteht in der Nutzung des Museumstandortes mit seinen umfassenden Sammlungen zur Beantwortung evolutionsbiologischer Fragestellungen auf der Grundlage molekularbiologischer Daten.

Mitarbeiterinnen & Mitarbeiter

Wissenschaftlerin / Wissenschaftler, Festanstellung

Dr. Lars Podsiadlowski

Leiter (kommissarisch) Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung, Wissenschaftlicher Leiter des Molekularlabors am ZMB

Tel: +49 228 9122-356

Fax: +49 228 9122-295

E-Mail: l.podsiadlowski [at] leibniz-zfmk.de

Technisches Personal

Anja Bodenheim

Tel: +49 228 9122-356

Fax: +49 228 9122-212

E-Mail: A.Bodenheim [at] leibniz-zfmk.de

Claudia Etzbauer

Labormanagerin, Technische Assistentin

Tel: +49 228 9122-295

Fax: +49 228 9122-295

E-Mail: c.etzbauer.zfmk [at] uni-bonn.de

Wissenschaftlerin / Wissenschaftler, Gast

Reihane Saberi-Pirooz

Gastwissenschaftlerin

E-Mail: R.Saberi.P [at] gmail.com

Doktorandin / Doktorand

Pracheta Rana

Doktorandin

Tel: +49 228 9122-421

Fax: +49 228 9122-212

E-Mail: prachetasrana [at] gmail.com

Projekte

2022

Untersuchung der genomischen und transkriptomischen Signaturen des globalen Wandels in einer marinen Fischart in Raum und Zeit

DFG Projekt in Kooperation mit Prof. Henrik Krehenwinkel (Projektleiter), Projektleitung Bonn: Dr. Christoph Mayer

Projektleitung:

Dr. Christoph Mayer

2021

Der Karibische Würfelfalter

Die Würfelfalter, Riodinidae, sind eine der sechs Schmetterlingsfamilien. Die meisten ihrer 1300 Arten sind in der Neotropis beheimatet, eine einzige monotypische Gattung lebt jedoch auf den Westindischen Inseln. Der Karibische Würfelfalter, Dianesia carteri, ist auf Kuba und die Bahamas beschränkt, wo mehrere isolierte Populationen bekannt sind. Ein erster Ansatz unter Verwendung von DNA Barcodes deutet darauf hin, dass Dianesia möglicherweise mehr als eine Art umfasst.

Projektleitung:

Dr. Rayner Nuñez

Finanzierung:

Alexander von Humboldt-Stiftung

2019

Einfluss von Landnutzung und Klimawandel auf äthiopische Frankoline

Diese Studie befasst sich mit zwei äthiopischen Frankolin-Arten und zielt auf umfassende Analysen von Schutzmaßnahmen und Landnutzungs-Management ab.

Projektleitung:

Abadi Mehari Abrha

Finanzierung:

Deutscher Akademischer Austauschdienst

Evolution der Ninetinae

Dieses Projekt befasst sich mit den Ninetinae, einer Unterfamilie der Zitterspinnen. Es handelt sich um winzige bodenlebende Tiere die überwiegend auf aride Gegenden beschränkt sind. Im phylogenetischen System der Zitterspinnen scheinen sie eine ‚basale‘ Stellung einzunehmen, so dass sie entscheidend sind für das Verständnis der Evolution der Zitterspinnen.

Projektleitung:

Dr. Bernhard A. Huber

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

Morphologie und Phylogenie der Schaben und Termiten

Die etwa 7500 Arten der Schaben und Termiten werden in dem Taxon Blattodea zusammengefasst. Ziel des Projektes ist die Klärung der Verwandtschaftsverhältnisse zwischen den einzelnen Teilgruppen der Blattodea, die Datierung der wichtigsten Aufspaltungen. Ausserdem werden die Kopfmorphologie und die Funktionsmorphologie der Mundwerkzeuge untersucht.

Projektleitung:

Dr. Benjamin Wipfler

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

2018

Evolution der polyneopteren Insekten

Polyneoptera ist eine der vier Großgruppen der geflügelten Insekten und besteht aus elf traditionellen Ordnungen wie den Heuschrecken (Orthoptera), den Ohrkneifern (Dermaptera) oder den Schaben (Blattodea). Die Verwandtschaftsverhältnisse zwischen diesen Teilgruppen und damit auch wichtige evolutive Erergnisse wie zum Beispiel der Ursprung von Sozialverhalten, Habitatpräferenzen oder morphologische Anpassungen sind vollkommen ungeklärt. In dem hier vorgestellten Projekt wird durch eine Kombination von phylogenomischen Analysen und detailierten phenotypischen Daten das erste umfassende Bild der Evolution der polyneopteren Insekten entworfen.

Projektleitung:

Dr. Benjamin Wipfler

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

Apollo population genomics

Parnassius apollo (Papilionidae) is an iconic butterfly species with a wide distribution from Spain to China. The distribution is, however, very spotwise, and e.g. in Germany only a few populations remain. It is the only non-tropical butterfly protected under the CITES The goal of this project is to use whole genome sequencing to investigate the genetic diversity of Parnassius apollo across space and time. To do this we will use both fresh and museum specimens collected across the range of the species, and during the last 120 years.

Projektleitung:

Dr. Marianne Espeland

Finanzierung:

Zoologisches Forschungsmuseum Alexander Koenig

SPP Taxonomics

Projektleitung:

Dr. Dirk Ahrens

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

2007

DNA-Bank-Netzwerk

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

Publikationen

Publiziert in

2018

Rakitov, R., Moysa, A.A., Kopylov, A.T., Moshkovskii, S.A., Peters, R.S., Meusemann, K., Misof, B., Dietrich, C.H., Johnson, K.P., Podsiadlowski, L., Walden, K.KO. (2018): Brochosomins and other novel proteins from brochosomes of leafhoppers (Insecta, Hemiptera, Cicadellidae). Insect Biochemistry and Molecular Biology 94, 10-17. https://doi.org/10.1016/j.ibmb.2018.01.001

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Peters, R.S., Niehuis, O., Gunkel, S., Bläser, M., Mayer, C., Podsiadlowski, L., Kozlov, A., Donath, A., van Noort, S., Liu, S., Zhou, X., Misof, B., Heraty, J., Krogmann, L., (2018): Transcriptome sequence-based phylogeny of chalcidoid wasps (Hymenoptera: Chalcidoidea) reveals a history of rapid radiations, convergence, and evolutionary success. Molecular Phylogenetics and Evolution. 120, 286–296. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2017.12.005

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Pauli, T., Burt, T., Meusemann, K, Bayless, K,. Donath, A., Podsiadlowski, L., Mayer, C., Kozlov, A., Vasilikopoulos, A., Liu, S., Zhou, X., Yeates, D., Misof, B., Peters, R.S., and Mengual, X. (2018): New data, same story: phylogenomics does not support Syrphoidea (Diptera: Syrphidae, Pipunculidae). Systematic Entomology 43(3), 447–459.

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Documents:

2018_syrphoidea.pdf

Sann, M., Niehuis, O., Peters, R.S., Mayer, C., Kozlov, A., Podsiadlowski, L., Bank, S., Meusemann, K., Misof, B., Bleidorn, C., Ohl, M. (2018): Phylogenomic analysis of Apoidea sheds new light on the sister group of bees. BMC Evolutionary Biology 18(1), 71. https://doi.org/10.1186/s12862-018-1155-8

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Johnson, K.P., Dietrich, C.H., Friedrich, F., Beutel, R.G., Wipfler, B., Peters, R.S., Allen, J.M., Petersen, M., Donath, A., Walden, K.K.O., Kozlov, A.M., Podsiadlowski, L., Mayer, C., Meusemann, K., Vasilikopoulos, A., Waterhouse, R.M., Cameron, S.L., Weirauch, C., Swanson, D.R., Percy, D.M., Hardy, N.B., Terry, I., Liu, S., Zhou, X., Misof, B., Robertson, H.M., Yoshizawa, K., (2018): Phylogenomics and the evolution of hemipteroid insects. Proceedings of the National Academy of Sciences: 201815820.

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2017

Bank, S., Sann, M., Mayer, C., Meusemann, K., Donath, A., Podsiadlowski, L., Kozlov, A., Petersen, M., Krogmann, L., Meier, R., Rosa, P., Schmitt, T., Wurdack, M., Liu, S., Zhou, X., Misof, B., Peters, R.S., Niehuis, O., (2017): Transcriptome and target DNA enrichment sequence data provide new insights into the phylogeny of vespid wasps (Hymenoptera: Aculeata: Vespidae). Molecular Phylogenetics and Evolution 116, 213–226. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2017.08.020

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Petersen, M., Meusemann, K., Donath, A., Dowling, D., Liu, S., Peters, R.S., Podsiadlowski, L., Vasilikopoulos, A., Zhou, X., Misof, B., Niehuis, O. (2017): Orthograph: a versatile tool for mapping coding nucleotide sequences to clusters of orthologous genes. BMC Bioinformatics. 18(1), 111. https://doi.org/10.1186/s12859-017-1529-8

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Peters, R.S., Krogmann, L., Mayer, C., Donath, A., Gunkel, S., Meusemann, K., Kozlov, A., Podsiadlowski, L., Petersen, M., Lanfear, R., Diez, P.A., Heraty, J., Kjer, K.M., Klopfstein, S., Meier, R., Polidori, C., Schmitt, T., Liu, S., Zhou, X., Wappler, T., Rust, J., Misof, B., Niehuis, O. (2017): Evolutionary History of the Hymenoptera. Current Biology. 27, 1013–1018. https://doi.org/10.1016/j.cub.2017.01.027

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2014

Ihlow, F., Ahmadzadeh, F., Ghaffari, H., Taskavak, E., Hartmann, T., Etzbauer, C., Rödder, D. (2014): Assessment of genetic structure, habitat suitability and effectiveness of reserves for future conservation planning of the Euphrates Softshell Turtle Rafetus euphraticus (Daudin, 1802). - Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems 24: 831-840; doi: 10.1002/aqc.2454.

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Töpfer, T., Podsiadlowski, L., Gedeon, K. (2014): Rediscovery of the Black-fronted Francolin Pternistis (castaneicollis) atrifrons (Conover, 1930) (Aves: Galliformes: Phasianidae) with notes on biology, taxonomy and conservation. – Vertebrate Zoology 64: 261-271.

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2012

HARTIG, G.*, PETERS, R.S.*, BORNER, J., ETZBAUER, C., MISOF, B., NIEHUIS, O. (2012) Oligonucleotide Primers for Targeted Amplification of Single-Copy Nuclear Genes in Apocritan Hymenoptera. PLoS ONE 7(6): e39826. * equal contributors

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NIEHUIS, O., PETERS, R.S., HARTIG, G., BORNER, J., ETZBAUER, C., MISOF, B. (2012) New primers for targeted amplification of nuclear genes in apocritan Hymenoptera. Mitteilungen des Entomologischen Vereins Stuttgart 47 (2):24.

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2010

BLUME, C., ETZBAUER, C., GAEDIKE, R., HEIDENREICH, U., KLEIKAMP, U., SCHNUG, L., SPEIDEL, W., STÜNING, D. (2010) Type material of Lepidoptera and Trichoptera in the ZFMK collection, Bonn. Bonn zoological Bulletin, 58: 169-215.

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2022

Untersuchung der genomischen und transkriptomischen Signaturen des globalen Wandels in einer marinen Fischart in Raum und Zeit

2021

Der Karibische Würfelfalter

2019

Einfluss von Landnutzung und Klimawandel auf äthiopische Frankoline

Evolution der Ninetinae

Morphologie und Phylogenie der Schaben und Termiten

2018

Evolution der polyneopteren Insekten

Apollo population genomics

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