BaitFisher

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Steckbrief

Titel des Projekts:

Hybrid Enrichment Methode mit BaitFisher

ZFMK-Projektleitung:

Dr. Christoph Mayer

Org. Einordnung:

Statistische Phylogenetik und Phylogenomik, Personalrat

Forschungsobjekt(e):

Biodiversität

Beschreibung

Bei der Hybrid Enrichment Methode werden sogenannte Sonden oder Baits verwendet um z.B. in genomischer DNA bestimmte Gene anzureichern. Siehe z.B. Mayer et al. 2016 für eine Einführung.

Das BaitFisher und BaitFilter Programm wurden entwickelt um Sonden/Baits zu generieren. Die Methode hat sich als ausgesprochen erfolgreich herausgestellt und wurde bereits in Zahlreichen Projekten am ZFMK aber auch darüber hinaus angewandt. Auf Google Scholar wurde das BaitFisher Paper in der Zeit seit der Publikation 2016 bis März 2020 bereits 40 mal zitiert.

Das Programm wird in mehreren Projekten am ZFMK und darüber hinaus verwendet.

U.A.wird das BaitFisher Programm in den folgenden Projekten eingesetzt:

- Taxonomics: https://www.zfmk.de/de/forschung/projekte/spp-taxonomics#info

- Sequenzierung von Museumsmaterial https://www.zfmk.de/de/forschung/projekte/spp-taxonomics#info