In den Räumlichkeiten des ZFMK finden jährlich verschiedenen nationale und internationale Tagungen, Kongresse, Symposien, Meetings und Workshops statt.
Im Rahmen der Bonner Thementage der Biodiversität finden die FörTaxCon (18.-19.11.2021) und die Konferenz der Arten (20.-21.11.2021) statt. Bei den beiden Konferenzen dreht sich alles um den Schutz der Artenvielfalt, Taxonomie, Umweltbeobachtungen und die Vermittlung von Artenkenntnissen.