Dr. Peter Grobe

Tel: +49 (0)228 9122 342

Fax: +49 (0)228 9122 212

E-Mail: p.grobe [at] leibniz-zfmk.de

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Profil

Aufgabenbereiche

Seit 2011 am Zoologischen Forschungsmuseum Alexander Koenig, Bonn. Leitung der Biodiversitätsinformatik mit den Schwerpunkten:

Digitalisierung der Naturhistorischen Sammlungen am ZFMK
Entwicklung von Datenstandards und -Schnittstellen für Forschungsdaten
IT Infrastruktur für das Biodiversitätsmonitoring
Trait Systeme für die Analyse von Monitoringdaten

Forschungsinteressen

Nachhaltige Software- und Datenarchitekturen
komplexe Softwaresysteme für Foschungsdaten
Semantische Phänotypen in der Morphologie und Taxonomie

Mitgliedschaften

Deutsche Zoologische Gesellschaft, Gesellschaft für Biologische Systematik

Projekte

2020

[22]

NFDI4Biodiversity [22]

NFDI4Biodiversity ist ein Konsortium unter dem Dach der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur, das sich der gemeinschaftlichen Nutzung von Biodiversitäts- und Umweltdaten widmet.

Abteilung/Sektion:

Projektleitung:

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

[23]

CaBOL - Caucasus Barcode of Life [23]

Eine georgisch-armenisch-deutsche Initiative, um Forschungsinfrastrukturen aufzubauen und die kaukasische Biodiversität zu erforschen und zu barcoden

Abteilung/Sektion:

Direktion [24], Lehrstuhl Spezielle Zoologie [25], Biobank [26], Abteilung Arthropoda [27], Biodiversitätsinformatik [18], Diptera [28], Verwaltung [29]

Projektleitung:

Prof. Dr. Bernhard Misof [30]

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

[31]

The BMBF-funded GBOL, the German Barcode of Life initiative, has been run successfully over the last eight years. It delivered an operative DNA barcode reference library for German animals, fungi and plants. However, a significant proportion of insect taxa has so far been excluded from GBOL and merely all biodiversity research, because no or only very insufficient expertise and information are available that allow to get a grip on them. They are called “Dark Taxa”.

Abteilung/Sektion:

Hymenoptera [32], Diptera [28], Lehrstuhl Spezielle Zoologie [25], Theriologie [33], Biobank [26], Biodiversitätsinformatik [18], Direktion [24], Zentrum für Biodiversitätsmonitoring und Naturschutzforschung (zbm) [34], Abteilung Arthropoda [27], Metabarcoding [35], Verwaltung [29], ZFMK Internationale Graduiertenschule [36], Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung (zmb) [37]

Projektleitung:

Dr. Ralph S. Peters [38]

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

2019

[39]

FOGS - Forensic Genetics for Species Protection [39]

Im FOGS-Projekt werden DNA-basierte Werkzeuge zur Bekämpfung des illegalen Handels mit geschützten Tierarten entwickelt.

Abteilung/Sektion:

Biobank [26], Direktion [24], Lehrstuhl Spezielle Zoologie [25], Biodiversitätsinformatik [18], Herpetologie [40], Verwaltung [29], Bioinformatische Genomik [41]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [42]

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

[43]

AMMOD: Eine „Wetterstation für Artenvielfalt“ [43]

Eine „Wetterstation für Artenvielfalt“ (AMMOD = Automated Multisensor Station for Monitoring of Species Diversity).

Abteilung/Sektion:

Zentrum für Biodiversitätsmonitoring und Naturschutzforschung (zbm) [34], Biodiversitätsinformatik [18], Metabarcoding [35]

Projektleitung:

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

2018

[45]

SolBioM [45]

Hauptziel des BMBF-geförderten Vorhabens ist die Diversifizierung eines internationalen Forschungskonsortiums, welches überwiegend aus Partnern aus Ost- und Südosteuropa besteht, um Fördermittel für ein multinationales FuE-Projekt im Rahmen von Horizon 2020 oder einem anderen EU-Programm zu beantragen.

Abteilung/Sektion:

Lehrstuhl Spezielle Zoologie [25], Ornithologie [46], Zentrum für Biodiversitätsmonitoring und Naturschutzforschung (zbm) [34], Direktion [24], Forschungsnetzwerke [47], Biodiversitätsinformatik [18], Presse/ Kommunikation/ Veranstaltungen [48]

Projektleitung:

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

2017

[49]

GGBC: Erfassung, Monitoring und Management der Kaukasischen Biodiversität [49]

Eine georgisch-deutsche Initiative, um die kaukasische Biodiversität zu erforschen und zu barcoden

Abteilung/Sektion:

Direktion [24], Lehrstuhl Spezielle Zoologie [25], Biobank [26], Abteilung Arthropoda [27], Coleoptera [50], Theriologie [33], Lepidoptera [51], Herpetologie [40], Verwaltung [29], ZFMK Internationale Graduiertenschule [36], Biodiversitätsinformatik [18], Metabarcoding [35], Myriapoda [52], Arachnida [53], Personalrat [54], Diptera [28], Hymenoptera [32], Vergleichende Genomik (Insekten) [55]

Projektleitung:

Prof. Dr. Bernhard Misof [30]

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

2016

[56]

Die Sammlungen - ein Kosmos [56]

Die Sonderdrucksammlung des Botanikers Eduard Strasburger (1844−1912) befindet sich seit Juni 2012 unter dem Dach des ZFMK (ZFMK Jahresbericht 2012: 69). Der renommierte Forscher Strasburger unterrichtete als Dozent über 30 Jahre an der Bonner Universität und erhielt im wissenschaftlichen Austausch Sonderdrucke aus aller Welt. Im Rahmen des „Verbundprojektes: Die Sammlungen - ein Kosmos.

Abteilung/Sektion:

Biohistoricum [57], Biodiversitätsinformatik [18], Biobank [26]

Projektleitung:

Dr. Katharina Schmidt-Loske [58]

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

[59]

BIOMON [59]

Hauptziel des BMBF-geförderten Vorhabens war, ein internationales Forschungskonsortium mit Partnern überwiegend aus Ost- und Südosteuropa aufzubauen, um Fördermittel für ein multinationales FuE-Projekt im Rahmen von Horizon 2020 oder eines anderen EU-Programms zu beantragen.

Abteilung/Sektion:

Direktion [24], Ornithologie [46], Biodiversitätsinformatik [18]

Projektleitung:

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

2014

[60]

eScience-Compliant Standards for Morphology [60]

In den letzten Jahrzehnten hat sich die Forschung in den Life Sciences erheblich verändert. Heute verwenden viele Wissenschaftler Computer für die Datenexploration, kompilieren neue Datensätze aus offen verfügbaren Daten und unter neuen Vorraussetzungen zu analysieren.

Abteilung/Sektion:

Biodiversitätsinformatik [18], Theriologie [33]

Projektleitung:

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

2013

[61]

GFBio [61]

Umweltforschung und Biologie richten sich an die großen Herausforderungen, die das Ökosystem und die Klimadynamik unseres Planeten betreffen. Um der Größenordnung und Komplexität der zulösenden Probleme gerecht zu werden, muss vor allem im Bereich des Wissensaustausches stärkerzusammengearbeitet werden.

Abteilung/Sektion:

Projektleitung:

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

2012

[62]

Global Genome Biodiversity Network (GGBN) [62]

Erarbeitung von Standards für den Erhalt molekularer Proben und molekularer Biodiversität.

Abteilung/Sektion:

Biobank [26], Ornithologie [46], Biodiversitätsinformatik [18]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [42]

[63]

1KITE: Die Evolution der Insekten [63]

1KITE ist ein internationales Forschungsprojekt, das die Evolutionsgeschichte der Insekten versucht in bisher nicht dagewesenem Umfang nachzuzeichnen. Ein wesentliches Ziel dieses Projektes ist die Rekonstruktion des Stammbaums der Insekten. Ein solcher ist Voraussetzung, um die mannigfaltigen Anpassungen der Insekten an ihre Umwelt im Laufe der Erdgeschichte besser verstehen zu können. Darüber hinaus können die gewonnenen Erkenntnisse aber auch für die Entwicklung von neuen Arzneimitteln oder Schädlingsbekämpfungsmitteln von großer Bedeutung sein. Zu diesem Zweck ist es vorgesehen, bis Ende…

Abteilung/Sektion:

Direktion [24], Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung (zmb) [37], Lehrstuhl Molekulare Biodiversitätsforschung [64], Statistische Phylogenetik und Phylogenomik [65], Personalrat [54], Bioinformatische Genomik [41], Hochleistungsrechner [66], Phylogenetik und Evolutionsbiologie [67], Hymenoptera [32], Biodiversitätsinformatik [18], Biobank [26], Morphologielabor [68]

Projektleitung:

Prof. Dr. Bernhard Misof [30]

2011

[69]

GBOL- German Barcode of Life [69]

German Barcode of Life ( GBOL ) ist ein vom BMBF gefördertes Projekt zur Inventarisierung und genetischen Charakterisierung der Tiere, Pflanzen und Pilze Deutschlands anhand von DNA-Barcodes.

Abteilung/Sektion:

Zentrum für Biodiversitätsmonitoring und Naturschutzforschung (zbm) [34], Lehrstuhl Spezielle Zoologie [25], Theriologie [33], Abteilung Arthropoda [27], Biobank [26], Direktion [24], Verwaltung [29], ZFMK Internationale Graduiertenschule [36], Coleoptera [50], Ichthyologie [70], Metabarcoding [35], Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung (zmb) [37], Fledermaus Beringungszentrale [71], Biodiversitätsinformatik [18], Arachnida [53], Lepidoptera [51], Myriapoda [52], Personalrat [54], Diptera [28], Hymenoptera [32], Herpetologie [40], Ornithologie [46]

Projektleitung:

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

[72]

BiNHum [72]

Beim BiNHum-Projekt handelt es sich um ein Gemeinschaftsprojekt des Humboldt-Rings vertreten durch die naturhistorischen Forschungssammlungen und Museen in Berlin, Bonn, Karlsruhe, München und Stuttgart. Es soll die IT-Komponente zur objektbezogenen Sammlungsdigitalisierung im Verbund abdecken. Im Einzelnen geht es um die Erschließung und Aufbereitung vorhandener dezentral verteilter digitaler Objektdaten, Prüfung und Anpassung etablierter Datenbanksysteme, Zuarbeiten für die beantragten bzw.

Abteilung/Sektion:

Biodiversitätsinformatik [18], Direktion [24]

Projektleitung:

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

[73]

FREDIE Projekt [73]

Morphologische und molekulare Erfassung sämtlicher Arten von Fischen, Mollusken und Eintagsfliegen des Süßwassers in Europa.

Abteilung/Sektion:

Ichthyologie [70], Biodiversitätsinformatik [18], Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung (zmb) [37], Theriologie [33]

Projektleitung:

PD Dr. Fabian Herder [74]

Finanzierung:

Leibniz-Gemeinschaft

[75]

Morph·D·Base-Erweiterung [75]

In den letzten Jahren hat sich die morphologisch basierte Forschung an Organismen durch die sehr schnelle Etablierung neuer Methoden, wie der Röntgentomographie (μCT, SRμCT), der Laser Scanning Microscopie (cLSM), der Digitalisierung histologischer Schnittserien, etc., stark verändert. All diese Methoden erzeugen extrem große Datenmengen, die aufgrund ihres ungewöhnlich hohen Informationsgehaltes, von besonderem wissenschaftlichem Wert sind. Bisher existiert allerdings kein Repositorium für die dauerhafte Speicherung dieser Datenmengen.

Abteilung/Sektion:

Projektleitung:

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

2010

[76]

AmiBio [76]

Automatisches akustisches Monitoring und Inventarisierung von Biodiversität.

Abteilung/Sektion:

Ornithologie [46], Biodiversitätsinformatik [18]

Projektleitung:

Dr. Olaf Jahn [77]

Finanzierung:

Europäische Union

2009

[78]

WissKI² [78]

Erweiterung der wissenschaftlichen Forschungsumgebung “WissKI” und Bildung eines Kompetenzzentrums für semantische Technologien

Abteilung/Sektion:

Biodiversitätsinformatik [18], Direktion [24]

Projektleitung: