Dr. Jonas Astrin

Sektionsleiter
Biobank-Kurator

Biobank [18]

Tel: +49 (0)228 9122 357

Fax: +49 (0)228 9122 6357

E-Mail: j.astrin [at] leibniz-lib.de

[20] [21]

Tabs

Profil

Forschungsinteressen

Biobank [22] -Management, Biospecimen Science, DNA-Konservierung, Zellkultur, DNA-Barcoding, Integrative Taxonomie, Wildtierforensik, LIS (Library and Information Science)

Mitgliedschaften

GGBN - Global Genome Biodiversity Network, ISBER - International Society for Biological and Environmental Repositories, Frozen Ark Consortium, DIN (Deutsches Institut für Normung) (Gremienarbeit), iBOL Science Committee, SWFS - Society for Wildlife Forensic Science, ICOM NATHIST, Bund Naturschutz (BUND), Naturschutzbund Deutschland (NABU), GDK - Gemeinschaft Deutscher Kryobanken

Weitere Profile im Netz

https://www.linkedin.com/in/jonas-astrin-b8480233/ [23]

Projekte

2022

[24]

CellGen [24]

The CellGen project is composed of two main parts. The first part investigates whether cell cultures accumulate mutations with progressive number of passages. One of the advantages of cell culture is to provide best quality of DNA/RNA and metaphases. Hence, we expect that cell culture will experience a renaissance in the light of high throughput sequencing techniques. However, it is still not clear how the number of passages (i.e., the number of times cells are transferred from vessel to vessel) can affect genetic and chromosomal composition.

Abteilung/Sektion:

Biobank [18], Vergleichende Genomik (Wirbeltiere) [25], Hymenoptera [26]

Projektleitung:

Dr. Camilla Bruno Di Nizo [27]

[28]

ERGA - The European Referen... [28]

Die Initiative Europäischer ReferenzGenom Atlas (ERGA) ist eine gesamteuropäische wissenschaftliche Antwort auf die aktuelle Bedrohung der biologischen Vielfalt. Referenzgenome bieten den umfassendsten Einblick in die genetische Grundlage jeder Art und stellen eine wichtige Ressource für das Verständnis der Funktionsweise der biologischen Vielfalt dar. ERGA zielt darauf ab, die Genome aller europäischen Arten zu sequenzieren und wird zu diesem Zweck einen interdisziplinären Arbeitsablauf einrichten.

Abteilung/Sektion:

Vergleichende Genomik (Wirbeltiere) [25], Lepidoptera [29], Diptera [30], Vergleichende Genomik (Insekten) [31], Biobank [18]

Projektleitung:

Astrid Böhne [32]

Finanzierung:

Europäische Union

2021

[33]

Genomic technology for the Caucasus [33]

It is planned to undertake 1) a comprehensive upgrade of researchinfrastructure in the molecular ecology laboratory at ISU, and 2) ajoint research investigation of biodiversity and refugial areas in the Caucasus region. Improvements to research infrastructure will providemodern biotechnology to researchers in the Caucasus region, including next generation sequencing (NGS) and real time PCR.

Abteilung/Sektion:

Direktion [34], Lehrstuhl Spezielle Zoologie [35], Biobank [18], Verwaltung [36]

Projektleitung:

Prof. Dr. Bernhard Misof [37]

2020

[38]

CaBOL - Caucasus Barcode of Life [38]

Eine georgisch-armenisch-deutsche Initiative, um Forschungsinfrastrukturen aufzubauen und die kaukasische Biodiversität zu erforschen und zu barcoden

Abteilung/Sektion:

Direktion [34], Lehrstuhl Spezielle Zoologie [35], Biobank [18], Abteilung Arthropoda [39], Biodiversitätsinformatik [40], Diptera [30], Verwaltung [36]

Projektleitung:

Prof. Dr. Bernhard Misof [37]

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

[41]

GBOL III: Dark Taxa [41]

The BMBF-funded GBOL, the German Barcode of Life initiative, has been run successfully over the last eight years. It delivered an operative DNA barcode reference library for German animals, fungi and plants. However, a significant proportion of insect taxa has so far been excluded from GBOL and merely all biodiversity research, because no or only very insufficient expertise and information are available that allow to get a grip on them. They are called “Dark Taxa”.

Abteilung/Sektion:

Hymenoptera [26], Diptera [30], Lehrstuhl Spezielle Zoologie [35], Theriologie [42], Biobank [18], Biodiversitätsinformatik [40], Direktion [34], Zentrum für Biodiversitätsmonitoring und Naturschutzforschung (zbm) [43], Abteilung Arthropoda [39], Metabarcoding [44], Verwaltung [36], ZFMK Internationale Graduiertenschule [45], Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung (zmb) [46]

Projektleitung:

Dr. Ralph S. Peters [47]

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

2019

[48]

FOGS - Forensic Genetics for Species Protection [48]

Im FOGS-Projekt werden DNA-basierte Werkzeuge zur Bekämpfung des illegalen Handels mit geschützten Tierarten entwickelt.

Abteilung/Sektion:

Biobank [18], Direktion [34], Lehrstuhl Spezielle Zoologie [35], Biodiversitätsinformatik [40], Herpetologie [49], Verwaltung [36], Bioinformatische Genomik [50]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [8]

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

[51]

Joint Danube Survey [51]

JDS betreibt das Monitoring von Schlüsselelementen der Wasserqualität (incl. Biodiversität) über die Länge der Donau und ihrer größeren Nebenflüsse.

Abteilung/Sektion:

Biobank [18]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [8]

[52]

DNA barcoding of benthic invertebrates from Lake Sevan (Armenia) [52]

Aufbau einer Referenzdatenbank von DNA-Barcodes für das Sewansee-Einzugsgebiet.

Abteilung/Sektion:

Biobank [18], Lepidoptera [29], Abteilung Arthropoda [39]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [8]

Finanzierung:

Deutscher Akademischer Austauschdienst

[53]

SYNTHESYS+ NA3.1 [53]

Das SYNTHESYS+ Unterprojekt NA3.1 sammelt bestehende Standards und Best Practices im Umfeld der Umwelt- und Biodiversitätsbiobanken und identifiziert nicht abgedeckte Bereiche.

Abteilung/Sektion:

Biobank [18]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [8]

Finanzierung:

Europäische Union

2018

[54]

ISBER Best Practices: Recommendations for Repositories [54]

Anleitung für das Sammeln, Handling, die Lagerung und Auslieferung von biologischen und Umwelt-Proben

Abteilung/Sektion:

Biobank [18]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [8]

[55]

Cell banking at the ZFMK Biobank [55]

Die ZFMK-Biobank archiviert Lebendzell-Material für die Forschung und Ex-situ-Konservierung.

Abteilung/Sektion:

Biobank [18], Hymenoptera [26]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [8]

2017

[56]

GGBC: Erfassung, Monitoring und Management der Kaukasischen Biodiversität [56]

Eine georgisch-deutsche Initiative, um die kaukasische Biodiversität zu erforschen und zu barcoden

Abteilung/Sektion:

Direktion [34], Lehrstuhl Spezielle Zoologie [35], Biobank [18], Abteilung Arthropoda [39], Coleoptera [57], Theriologie [42], Lepidoptera [29], Herpetologie [49], Verwaltung [36], ZFMK Internationale Graduiertenschule [45], Biodiversitätsinformatik [40], Metabarcoding [44], Myriapoda [58], Arachnida [59], Personalrat [60], Diptera [30], Hymenoptera [26], Vergleichende Genomik (Insekten) [31]

Projektleitung:

Prof. Dr. Bernhard Misof [37]

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

[61]

Optimizing and standardizing the preservation of animal tissue for molecular biodiversity research [61]

Zu einem besseren, komparativen Verständnis der Wirkung einiger der häufigsten beim zoologischen Biobanking genutzten Konservierungs-/Fixierungsflüssigkeiten.

Abteilung/Sektion:

Biobank [18]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [8]

2014

[62]

Bumbuna Phase II [62]

Baseline-Studie & Monitoring vor und nach der Flutung des Bumbuna-Stausees.

Abteilung/Sektion:

Theriologie [42], Präparation [63], Ichthyologie [64], Biobank [18]

Projektleitung:

Dr. Jan Decher [65]

Finanzierung:

Combined Ecology, BTO Services Ltd., UK

[66]

ESBB & ISBER Enviro-Bio Working Group [66]

Die Enviro-Bio Arbeitsgruppe ist der Zusammenschluss von Biodiversität-Biobanken innerhalb von ISBER und ESBB, d.h. der internationalen und der europäischen Biobank-Vereinigungen.

Abteilung/Sektion:

Biobank [18]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [8]

2012

[67]

Frozen Ark Projekt [67]

Netzwerk für Ex-Situ-Konservierung molekularer Biodiversität

Abteilung/Sektion:

Biobank [18]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [8]

[68]

Global Genome Biodiversity Network (GGBN) [68]

Erarbeitung von Standards für den Erhalt molekularer Proben und molekularer Biodiversität.

Abteilung/Sektion:

Biobank [18], Ornithologie [69], Biodiversitätsinformatik [40]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [8]

2011

[70]

GBOL- German Barcode of Life [70]

German Barcode of Life ( GBOL ) ist ein vom BMBF gefördertes Projekt zur Inventarisierung und genetischen Charakterisierung der Tiere, Pflanzen und Pilze Deutschlands anhand von DNA-Barcodes.

Abteilung/Sektion:

Zentrum für Biodiversitätsmonitoring und Naturschutzforschung (zbm) [43], Lehrstuhl Spezielle Zoologie [35], Theriologie [42], Abteilung Arthropoda [39], Biobank [18], Direktion [34], Verwaltung [36], ZFMK Internationale Graduiertenschule [45], Coleoptera [57], Ichthyologie [64], Metabarcoding [44], Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung (zmb) [46], Fledermaus Beringungszentrale [71], Biodiversitätsinformatik [40], Arachnida [59], Lepidoptera [29], Myriapoda [58], Personalrat [60], Diptera [30], Hymenoptera [26], Herpetologie [49], Ornithologie [69]

Projektleitung:

Prof. Dr. J. Wolfgang Wägele [72]

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

[73]

Molecular Weevil Identification [73]

Aufbau einer DNA-Barcode-Referenzbibliothek der europäischen Rüsselkäferfauna und dazugehöriger molekularer und morphologischer Sammlungen

Abteilung/Sektion:

Biobank [18], Coleoptera [57]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [8]

2007

[74]

DNA-Bank-Netzwerk [74]

Abteilung/Sektion:

Direktion [34], Molekularlabor [75], Biobank [18], Lehrstuhl Spezielle Zoologie [35], Lehrstuhl Molekulare Biodiversitätsforschung [76]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [8]

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

[77]

Integrative Taxonomie an kryptischen Rüsselkäfern [77]

Integrative Taxonomie und DNA-Barcoding bei westpaläarktischen Rüsselkäfern der Unterfamilie Cryptorhynchinae

Abteilung/Sektion:

Biobank [18]

Projektleitung:

Dr. Jonas Astrin [8]

Finanzierung:

Deutsche Forschungsgemeinschaft

Publikationen

Publiziert in

2021

Mengual, X., Gimnich, F., Petersen, H., Astrin, J. J. (2021): Natural history wet collections: observations on pH readings from the use of different ethanol and label types. - Collection Forum (2019) 33 (1): 7-17.

[Mehr] [81]

Muster, C., Spelda, J., Rulik, B., Thormann, J., von der Mark, L., Astrin, J.J. (2021): The dark side of pseudoscorpion diversity: The German Barcode of Life campaign reveals high levels of undocumented diversity in European false scorpions. - Ecology and Evolution 11, 13815–13829.

[Mehr] [82]

Links:

https://doi.org/10.1002/ece3.8088 [83]

Stüben, P.E., Schütte, A., Astrin, J.J. (2021): Barcoding and interspecific relationships of Macaronesian Weevils (Coleoptera: Curculionoidea). - Contributions to Entomology 71, 127–135.

[Mehr] [84]

Links:

https://doi.org/10.21248/contrib.entomol.71.1.127-135 [85]

Weigand, A.M. and Astrin, J.J. (2021) Introduction: (e)DNA-based activities. In Liška, I., Wagner, F., Sengl, M., Deutsch, K., Slobodník, J. and Paunovic, M. (eds.), Joint Danube Survey 4 Scientific Report: A Shared Analysis of the Danube River. International Commission for the Protection of the Danube River, Vienna, pp. 115-120. ISBN 978-3-200-07450-7

[Mehr] [86]

Links:

http://www.danubesurvey.org/jds4/publications/scientific-report [87]

2020

Leese, F., Beermann, A.J., Zizka, V. unter Mitarbeit von Astrin, J., Bálint, M., Bourlat, S., Buchner, D., Elbrecht, V., Hörren, T., Krehenwinkel, H., Monaghan, M., Morinière, J., Pauls, S.U., Schäffler, L., Weigand, A. 2020 Potenzial genetischer Methoden für die Erfassung und das Monitoring von Insekten. Ausarbeitung im Rahmen des F+E-Vorhabens „Konzeptentwicklung zum bundesweiten Insektenmonitoring"

[Mehr] [88]

Auliya, M., Hofmann, S., Segniagbeto, G.H., Assou, D., Ronfot, D., Astrin, J.J., Forat, S., Ketoh, G.K.K., D'Cruze, N. (2020): The first genetic assessment of wild and farmed ball pythons (Reptilia, Serpentes, Pythonidae) in southern Togo. - Nature Conservation 38: 37–59.

[Mehr] [89]

Links:

https://doi.org/10.3897/natureconservation.38.49478 [90]

Epitashvili, G., Geiger, M., Astrin, J.J., Herder, F., Japoshvili, B., Mumladze, L. (2020): Towards retrieving the Promethean treasure: a first molecular assessment of the freshwater fish diversity of Georgia. Biodiversity Data Journal 8: e57862. https://doi.org/10.3897/BDJ.8.e57862

[Mehr] [91]

Giebner, H., Langen, K., Bourlat, S.J., Kukowka, S., Mayer, C., Astrin, J.J., Misof, B., Fonseca, V.G. (2020): Comparing diversity levels in environmental samples: DNA sequence capture and metabarcoding approaches using 18S and COI genes. - Molecular Ecology Resources 20: 1333–1345.

[Mehr] [92]

Links:

https://doi.org/10.1111/1755-0998.13201 [93]

Kefelioglu, H., Krystufek, B., Selçuk, A.Y., Hutterer, R. and Astrin, J.J. (2020): Taxonomic revision of the Levant moles of Turkey (Mammalia: Talpidae). - Bonn zoological Bulletin 69, 275–291.

[Mehr] [94]

Links:

https://doi.org/10.20363/BZB-2020.69.2.275 [95]

2019

Hutterer, R., Decher, J., Monadjem, A., Astrin, J. J. (2019): A new genus and species of vesper bat from West Africa, with notes on Hypsugo, Neoromicia, and Pipistrellus (Chiroptera: Vespertilionidae). - Acta Chiropterologica 21: 1-22.

[Mehr] [96]

Links:

http://dx.doi.org/10.3161/15081109ACC2019.21.1.001 [97]

Barker, K., Astrin, J. J., Droege, G., Coddington, J. and Seberg, O. (2019): An Evolving Business Model for a Biodiversity Biobank Network: GGBN. - Biodiversity Information Science and Standards 3: e37154.

[Mehr] [98]

Links:

http://dx.doi.org/10.3897/biss.3.37154 [99]

Barker, K., Astrin, J. J., Droege, G., Coddington, J., Seberg, O. (2019): Furthering Genomic Research Infrastructures: The Global Genome Biodiversity Network. - Biodiversity Information Science and Standards 3: e37155.

[Mehr] [100]

Links:

http://dx.doi.org/10.3897/biss.3.37155 [101]

Thormann, Jana, Dirk Ahrens, Cort Anderson, Jonas J. Astrin, Levan Mumladze, Björn Rulik, David Tarkhnishvili, Marianne Espeland, Matthias Geiger, Nils Hein, Giorgi Iankoshvili, Elisabeth Karalashvili, Ximo Mengual, Carsten Morkel, Marco T. Neiber, Ralph S. Peters, André Reimann, Axel Ssymank, Thomas Wesener, Joachim Ziegler & Bernhard Misof (2019): A prelude to the Caucasus Barcode of Life Platform (CaBOL): Biodiversity Days in Georgia in 2018 and 2019. – Bonn zoological Bulletin 68 (2): 275–296.

[Mehr] [102]

Links:

[Fulltext PDF] [103]

Seberg, O., Droege, G., Astrin, J. J., Barker, K., Coddington, J. (2019): SYNTHESYS+ Molecular Collections in the Age of Genomics: Standards and processes. - Biodiversity Information Science and Standards 3: e38493.

[Mehr] [104]

Links:

http://dx.doi.org/10.3897/biss.3.38493 [105]

Weber, N., Wistuba, R., Astrin, J. J., Decher, J. (2019): New records of bats and terrestrial small mammals from the Seli River in Sierra Leone before the construction of a hydroelectric dam. - Biodiversity Data Journal 7: e34754.

[Mehr] [106]

Links:

http://dx.doi.org/10.3161/15081109ACC2019.21.1.001 [97]

2018

Astrin, J. J., Baker, S., Barker, K., et al. (contributors) (2018): ISBER Best Practices: Recommendations for Repositories - Guidance for the Collection, Handling, Storage, and Distribution of Biological and Environmental Specimens. - Online resource (103 pages), PDF available from ISBER website: http://www.isber.org/default.asp?page=BPR

[Mehr] [107]

Links:

http://www.isber.org/default.asp?page=BPR [108]

Astrin, J., Heine, S., Koch, C., Rödder, D., Töpfer, T., Wägele, W. (2018): Zoologisches Forschungsmuseum Alexander Koenig in Bonn: Transformation of a Classical Natural History Museum of the Nineteenth Century into a Biodiversity Research Institution. - In: Beck, L. A. (ed.): Zoological Collections of Germany. - Springer (Cham), pp. 153-182.

[Mehr] [109]

Campbell, L. D., Astrin, J. J., De Souza, Y., Giri, J. G., Patel, A. A., Rawley-Payne, M., Rush, A., Sieffert, N. (eds.) (2018): ISBER Best Practices: Recommendations for Repositories - Guidance for the Collection, Handling, Storage, and Distribution of Biological and Environmental Specimens. - Online resource (103 pages), PDF available from ISBER website: https://www.isber.org/page/BPR

[Mehr] [110]

Links:

ISBER Best Practices, 4th Ed. (2018) [111]

Campbell, L. D., Astrin, J. J., DeSouza, Y., Giri, J., Patel, A. A., Rawley-Payne, M., Rush, A., Sieffert, N. (2018): The 2018 Revision of the ISBER Best Practices: Summary of Changes and the Editorial Team's Development Process. - Biopreservation and Biobanking 16: 3-6.

[Mehr] [112]

Links:

http://dx.doi.org/10.1089/bio.2018.0001 [113]

Kryštufek, B., Nedyalkov, N., Astrin, J. J. & Hutterer, R. (2018): News from the Balkan refugium: Thrace has an endemic mole species (Mammalia: Talpidae). - Bonn Zoological Bulletin 67: 41–57.

[Mehr] [114]

Links:

http://www.zoologicalbulletin.de/articles/bzb-2018/370-volume-67-1-august-2018 [115]

Seiten

Berufserfahrung

seit 2010
Wissenschaftlicher Mitarbeiter am Zentrum für Molekulare Biodiversität, ZFMK;
Biobank-Kurator und Sektionsleiter (Molekulare Taxonomie und Biobank)

2007-2010
Wissenschaftlicher Mitarbeiter am Zoologischen Forschungsmuseum Alexander Koenig; eigenes Promotionsprojekt

2005-2007
Wissenschaftliche Hilfskraft am Deutschen Referenzzentrum für Ethik in den Biowissenschaften

Ausbildung

2010 Dr. rer. nat. (Zoologie), Universität Bonn

2008 M.A. (Library and Information Science), Humboldt-Universität Berlin

2005 Diplom (Biologie), Universität Bonn

2003 Magister-Zwischenprüfung (Philosophie), Universität Würzburg

2002 Vordiplom (Biologie), Universität Würzburg

Förderung

2020-2023
Bundesministerium für Bildung und Forschung:
CaBOL: Caucasus Barcode of Life

2020-2023
Bundesministerium für Bildung und Forschung:
GBOL (German Barcode of Life) III: Dark Taxa

2019-2022
Bundesministerium für Bildung und Forschung:
FOGS - Forensic Genetics for Species Protection: Sichere Herkunftszuordnung bei geschützten Tierarten

2019-2022
Bundesministerium für Bildung und Forschung:
Development of AMMOD Stations - Weather Stations for Species Diversity

2019-2023
EU-Kommission (Horizon 2020):
Synthesis of systematic resources (SYNTHESYS+), Koordination NA3.1

2017-2020
Bundesministerium für Bildung und Forschung:
German-Georgian Biodiversity Center

2016-2018
Bundesministerium für Bildung und Forschung:
German Barcode of Life (GBOL) 2

2011-2015
Bundesministerium für Bildung und Forschung:
GBOL – German Barcode of Life

2007-2011
Deutsche Forschungsgemeinschaft:
Integrative Taxonomie bei Rüsselkäfern

2008
Alexander Koenig Stiftung:
Baumkronenbenebelungen im makaronesischen Lorbeerwald

2004-2005
Alexander Koenig Stiftung:
DNA-Taxonomie bei Zitterspinnen

2000-2001
Studienstipendium der University of Texas, Austin

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